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非标记定量方法分析强直性脊柱炎患者髋关节韧带部位的蛋白质表达变化  
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【英文题名】 Analyzing the Relative Expression of Proteins Which Detected from the Ligament of Hip Joint of Ankylosing Spondylitis by Label-free Quantitative Technique
【作者】 王翠;
【导师】 钟扬;
【学位授予单位】 复旦大学;
【学科专业名称】 生物信息
【学位年度】 2014
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 复旦大学
【网络出版投稿时间】 2015-09-11
【关键词】 强直性脊柱炎; LC-MS/MS; 非标记定量; 生物信息;
【英文关键词】 Ankylosing spondylitis; LC-MS/MS; laber-free; bioinformatics;
【中文摘要】 强直性脊柱炎(Ankylosing spondylitis, AS)是一种自身免疫性疾病,以慢性炎症及异常骨化为主要特征。由于AS病变部位样本难以取得,现阶段大多研究都采用AS患者的外周血及滑膜组织进行相关分析,对其发病机制的了解十分有限。为了研究AS发病机理尤其是它的骨化机制,本实验选取了3个AS患者及3个正常股骨颈骨折病人的髋关节韧带组织,利用HPLC-MS/MS技术鉴定其蛋白质组成、利用非标记定量技术对蛋白质进行定量并进行生物信息学分析。同时,将本实验鉴定到的蛋白质与同样来自于AS髋关节韧带组织的基因芯片数据筛选出的差异表达基因进行分析比较,以此确立一些更可靠的与AS发病相关的基因,为研究AS的发病机理及寻找其药物靶点奠定基础。质谱鉴定结果发现,仅在AS病人中鉴定到的蛋白质有415个,仅在对照中鉴定到的蛋白由116个,共同鉴定到的有716个。其中有许多与炎症及骨化相关的蛋白如Collagen家族.SLC9A3R1、HIST2H2AC、TNFRSF11B、ALPL、MMP13、 TGFB1I1、ARL6IP5、COMP、TGFBI、CALM1、CALM2、MMP2、MMP3、 CD44、SPTBN1、CA...
【英文摘要】 Ankylosing spondylitis (AS) is autoimmune disease characterized by chronic inflammation and abnormal ossification. At present, peripheral blood and synovial was the most common tissue in the research of AS because of the lesion tissue was hard to get and the knowledge on the pathogenesis of AS was rather limited. HPLC-MS/MS and label-free quantitation technology was used to analysis the proteomics of lesions from hip joint ligament.3 AS and 3 control samples were selected to study the pathogenesis of AS, es...
【更新日期】 2016-01-05

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