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调控水稻光敏不育基因的pms3的RNA二级结构测定和RPA3017蛋白的晶体结构研究  
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【英文题名】 RNA Secondary Structure of Pms3 Which Regulates The Photoperiod-Sensitive Male Sterility in Rice And The Crystal Structure of Protein RPA3017
【作者】 杨雪菲;
【导师】 张启发;
【学位授予单位】 华中农业大学;
【学科专业名称】 生物化学与分子生物学
【学位年度】 2015
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 华中农业大学
【网络出版投稿时间】 2015-08-11
【关键词】 水稻; 光敏雄性不育; long; non-coding; RNA; RNA二级结构; 双组分系统; 反应调节因子; 蛋白晶体结构;
【英文关键词】 rice; long non-coding RNA; RNA secondary structure; photosynthetic bacterium; two-component system; response regulator; crystallographic structure;
【中文摘要】 农垦58S为光温敏雄性核不育水稻品种,其在长日高温下不育、在短日低温下可育,是水稻育种中两系法的重要种质资源。前人已对控制这种光敏感核不育的基因进行了遗传定位与分析,研究发现pms3是直接导致农垦58S与农垦58育性分离的基因,分离克隆后对其进行初步功能研究发现pms3的候选基因transcript-1不编码蛋白质而是转录成为long non-coding RNA(lnc RNA),在58S与58N中仅有一个SNP的差别。pms3的trascript-1转录出的RNA并不翻译蛋白质,所以研究其发挥功能的机理可以通过研究其作为mi RNA对下游的核酸或蛋白质互作起到的调控育性的作用,或者依靠研究其作为lnc RNA折叠出二级结构然后与蛋白质相互作用从而发挥的功能。RNA的二级结构可以利用软件预测和实验探测两种方法来研究,本研究用了多种预测RNA二级结构的软件,对transcript-1的全长以及截短部分结构进行了预测,并且在实验方法上用引物扩增法分析二羟基酰化(SHAPE)以及其他化学方法测定transcript-1转录的lnc RNA的二级结构,试图分析结构对其功能发挥的作用,以及其在SNP周围以及mi RN...
【英文摘要】 The discovery of photo-sensitive genic male sterile(PSMS) rice Nongken 58 S, which was complete sterile under long-day conditions and fertile under short-day conditions, was an important resource for two-line hybrids. Many groups have carried out genetic analysis and mapping of the gene that regulates PSMS, finding that pms3 locus was the cause. Studies showed that transcript-1, the candidate gene of pms3, was a long non-coding RNA(lnc RNA). A spontaneous mutation caused a single nucleotide polymorphism(SNP...
【更新日期】 2016-01-11

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