中国优秀硕士学位论文全文数据库
  关闭
铁钉菜(Ishige okamurae)转录组分析  
   在线阅读 整本下载 分章下载 分页下载本系统暂不支持迅雷或FlashGet等下载工具
【英文题名】 Transcriptome Analysis of Ishige Okamurae
【作者】 曲洁琼;
【导师】 刘涛;
【学位授予单位】 中国海洋大学;
【学科专业名称】 海洋生物学
【学位年度】 2014
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 中国海洋大学
【网络出版投稿时间】 2014-10-08
【关键词】 转录组; MAPK信号通路; 囊泡运输体系; 基础转录因子; Rab蛋白;
【英文关键词】 Ishige okamurae; comparative genomics; SSR; environmental; acclimation;
【中文摘要】 铁钉菜是铁钉菜属(Ishige)的代表物种。铁钉菜能够适应复杂多变的潮间带生境,能够在极度失水胁迫下保持一定的细胞活性,因此铁钉菜被认为是潮间带褐藻中耐受严酷干燥与日晒的典型物种,表现出较强的环境适应性。其抗干露、渗透压变化等众多环境胁迫的机制机理,已引发科研人员的广泛关注与探索。但是,与抗逆相关的众多基因、通路尚处于未知状态。 本论文通过Illumina HiSeq2000平台对铁钉菜进行高通量转录组测序,共获得12,548,489条原始序列,总长达2,258,728,020bp,平均读长为180bp,GC含量为52.19%。拼接之后,共获得78,583条scaffolds,平均读长为613bp,N50值为1709。通过nr注释,设定阈值为10-5,共得到25,357个unigenes。通过COG注释,共得到14,623个有功能匹配的unigenes,分布于25个COG的条目中。通过KEGG通路分析,共有4,184个unigenes注释到294条通路上。其中,有1,562个unigenes注释到“代谢(Metabolism)”相关的通路中;849个unigenes注释到“遗传信息处理(Genetic...
【英文摘要】 Ishige okamurae is the typical species of the genus Ishige. As I. okamuraeinhabits in upper intertidal zone, an environment of harsh extremes, it has welladapted to oxidative stresses such as intense light and high oxygen concentrations, yetnot been affected by any photodynamic damage, suggesting particular antioxidativemechanism as well as potent antioxidative compounds. But little is known about keygenes or particular metabolic pathways involved in I. okamurae and this summons usup for carrying out global...
【更新日期】 2015-01-09

【相同导师文献】

导师:刘涛    导师单位:中国海洋大学    学位授予单位:中国海洋大学
[1] 徐从杰.ADECO-RS工法超前深孔注浆对地层扰动机理及加固技术研究[D]. 中国海洋大学,2015
[2] 李洪利.光纤光栅传感器在海床超孔压监测中的适用性研究[D]. 中国海洋大学,2015
[3] 翟才雅.青岛地铁隧道施工阶段围岩分级细化方法研究与应用[D]. 中国海洋大学,2015
[4] 吕辉.海带(Saccharina japonica)钒依赖型溴过氧化物酶基因(vBPO)的分子系统学研究、原核表达与酶活检测[D]. 中国海洋大学,2014
[5] 封艳静.海藻糖和纤维素合成通路相关基因在海带(Saccharina japonica)及脆江蓠(Gracilaria chouae)中的分析[D]. 中国海洋大学,2014
[6] 李天勇.裙带菜Undaria pinnatifida线粒体全基因组研究及藻类线粒体基因组比较分析[D]. 中国海洋大学,2014
[7] 曲洁琼.铁钉菜(Ishige okamurae)转录组分析[D]. 中国海洋大学,2014
[8] 王忍.海带(Saccharina japonica)褐藻胶合成途径若干基因的克隆、表达以及功能验证[D]. 中国海洋大学,2014
[9] 陈允斌.基于实测数据的深基坑支护结构安全状态量化动态分析方法探讨[D]. 中国海洋大学,2013
[10] 王晓伟.复杂基坑群施工过程危害防治研究[D]. 中国海洋大学,2013

xxx
【读者推荐文章】中国期刊全文数据库 中国重要报纸全文数据库 中国博士学位论文全文数据库 中国优秀硕士学位论文全文数据库 中国重要会议论文全文数据库
【相似文献】
中国期刊全文数据库
中国优秀硕士学位论文全文数据库
中国博士学位论文全文数据库
中国重要会议论文全文数据库
中国重要报纸全文数据库
中国学术期刊网络出版总库
点击下列相关研究机构和相关文献作者,可以直接查到这些机构和作者被《中国知识资源总库》收录的其它文献,使您全面了解该机构和该作者的研究动态和历史。
【文献分类导航】从导航的最底层可以看到与本文研究领域相同的文献,从上层导航可以浏览更多相关领域的文献。

农业科学
  水产、渔业
   水产基础科学
    水产生物学
     水产植物学
  
 
  CNKI系列数据库编辑出版及版权所有:中国学术期刊(光盘版)电子杂志社
中国知网技术服务及网站系统软件版权所有:清华同方知网(北京)技术有限公司
其它数据库版权所有:各数据库编辑出版单位(见各库版权信息)
京ICP证040431号    互联网出版许可证 新出网证(京)字008号