【英文题名】
Research on the Algorithm of Charge Distribution in Molecular Dynamics Simulations Based on GPU
【作者】
张德好 ;
【导师】
刘青昆 ;
【学位授予单位】
辽宁师范大学 ;
【学科专业名称】
计算机系统结构
【学位年度】
2012
【论文级别】
硕士
【网络出版投稿人】
辽宁师范大学
【网络出版投稿时间】
2013-03-29
【关键词】
GPU通用计算 ;
集群系统 ;
ABEEMσπ模型 ;
分子动力学模拟 ;
电荷分布 ;
【英文关键词】
GPGPU ;
PC cIusters ;
ABEEMσπ model ;
Molecular Dynamics ;
Charge ;
distribution ;
【中文摘要】
图形处理器(GPU)因为其独特的硬件架构,硬件性能提升一直非常迅速。GPU在密集型运算方面表现出的强大性能,使其在通用计算领域得到了越来越多的重视。GPU通用计算的概念很早就被提出,但受限于编程复杂度和精度等问题,一直没有得到广泛的应用。随着CPU性能瓶颈的到来,以及现代GPU在可编程性的等方面不断提高,GPU开始作为密集型计算的协处理器得到了广泛的应用。主要的GPU厂商NVIDIA和AMD都推出了自己的GPGPU编程模型,并不断的提供改进。CUDA (Compute Unified Device Architecture)是由NVIDIA公司提供的面向GPU的并行通用计算构架,提供支持使用C语言进行开发的编程模型,解决了过去使用GPU开发需要过度依赖于图形处理API的缺点,大大降低了开发人员面向GPU编程的难度,并加入了对双精度的支持,提供了一个完整的GPU通用运算解决方案。
分子动力学模拟是应用分子动力学方法对凝聚态物质的微观结构和运动进行数值模拟的计算机模拟方法。以分子动力学法构建分子体系的数学模型,通过计算模仿出分子体系的行为。分子动力学模拟在很多方面严重依赖于大规模高密度计算,对高性能计算能...
【英文摘要】
Because of unique hardware architecture of graphics processor unit (GPU), hardware performance improvement has been very rapid. GPU demonstrates strong performance in intensive operations, so it gets more and more attention in the field of general purpose computing. The computing concept of GPU was presented in the very early, but it has not been widely used subject to the programming complexity and accuracy issues. With the advent of the CPU performance bottlenecks, as well as modern GPU programmability on...
【更新日期】
2014-07-17
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