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水稻农艺和品质若干性状的全基因组初步关联分析  
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【英文题名】 Preliminary Genome-wide Association Mpping of Some Agronomic and Ouslity Traits in Rice(Oryza Sativa L.)
【作者】 唐富福;
【导师】 包劲松;
【学位授予单位】 浙江大学;
【学科专业名称】 生物物理学
【学位年度】 2013
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 浙江大学
【网络出版投稿时间】 2013-07-10
【关键词】 水稻; 全基因组关联分析; 农艺性状; 营养性状; 淀粉品质性状;
【英文关键词】 Rice; Genome-wide association study; agronomic traits; nutritional traits; starch; quality traits;
【中文摘要】 水稻的许多农艺和品质性状如粒形、千粒重、营养品质和淀粉品质等,是基因和环境相互作用所控制的数量性状,其遗传研究较困难。与此同时,深入挖掘、利用水稻重要性状遗传变异对改良水稻品种至关重要。近年来,随着挖掘覆盖全基因组的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)标记技术的不断改进,基于连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)的全基因组关联分析为研究复杂数量性状提供了新途径。本研究利用覆盖全基因组1288个SNP标记对20份水稻材料两年间的14个农艺性状、5个营养性状和8个淀粉品质性状进行了全基因组关联分析初步研究,为后续研究提供借鉴。其主要结果如下： 1、群体结构分析发现20份水稻材料分为籼稻和粳稻两个亚群,主成分分析能看到明显的亚群分布,前四个主成分解释54.1%的基因型变异。通过比较6个模型Anova、K、P、P+K、Q、Q+K选择最适模型进行全基因组关联分析。 2、对两年间14个农艺性状全基因组关联分析共检测到17个SNP,分布于除第6、8外所有染色体上。稻谷粒长和糙米粒长检测到的标记位点与已克隆的基因GS3相近,且在...
【英文摘要】 Agronomic and quality traits such as grain shape,1000grain weight, and physicochemical properties are quantitative traits that are controlled by mutli-genes and affected by genotype by environment interaction. Dissection of the genetic basis of these complex traits is difficult. Deep dissection and utilization of the important genetic variations is very important for rice breeding. With the technical development of mining the single nucleotide polymorphisms (SNP) in target genome, genome-wide association st...
【更新日期】 2013-08-12

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