【英文题名】
Structure and Phylogenetic Analysis of Three Classes of Rice Disease Resistance Homologues
【作者】
王庭璋 ;
【导师】
薛庆中 ;
【学位授予单位】
浙江大学 ;
【学科专业名称】
生物信息学
【学位年度】
2006
【论文级别】
硕士
【网络出版投稿人】
浙江大学
【网络出版投稿时间】
2006-09-06
【基金】
国家自然科学基金
【关键词】
植物抗病基因 ;
同源搜索 ;
水稻 ;
密码子偏好性 ;
进化分歧年代 ;
【英文关键词】
plant disease resistance gene ;
homology search ;
rice ;
codon bias ;
evolution divergent time ;
【中文摘要】
植物在同病原生物的共进化中,形成了自己的一套防卫体系,其中抗病基因在其中扮演着举足轻重的角色,自1992年克隆出第一个抗病基因Hml之后,至2004年,已陆续从多种植物中克隆出来了40多个抗病基因。水稻中也克降出Xa21、Pib、Pi-ta2等抗病基因。水稻两个亚种全基因组测序的完成,使得我们有机会在其中发现抗病基因同源物,并进一步为克隆抗病基因和抗病育种作好铺垫。
1.水稻LRR-TM同源物的分布和结构特征
鉴于LRR-TM(富亮氨酸重复-跨膜区)同源物具有一个细胞外的LRR结构域和一个跨膜的螺旋结构。我们通过同源搜索,在籼稻和粳稻基因组中发现翻译后同时具有这两个特征结构域蛋白分别有174个和149个,将其作为LRR-TM同源物的候选。它们在染色体上的分布,既有单基因,也有基因簇形式。其中两个亚种基因组中分别有14个同源物同时具有信号肽和跨膜结构域,与番茄的Cf抗性基因相似。LRR-TM同源物的缺失或扩增事件主要发生在基因簇中。通过比较籼粳稻两个亚种中的高相似性序列,我们认为多数LRR-TM同源物的形成在籼粳稻分化之前,少数(35%)在分化之后。基于系统进...
【英文摘要】
Plants have formed their own defense systems in the long history of coevolution with various pathogen, in which disease resistance genes (R genes) play important roles. Since the first R gene Hml has been cloned in 1992, more than 40 have been cloned from many plant species, which includes rice, tomato, and so on. Rice is a most important crop in the world, from which, some R genes, such as Xa21, have been obtained. It can strong the cultivated rice species when R genes were introduced to them, but one or t...
【更新日期】
2006-10-24
【相同导师文献】
导师：薛庆中 导师单位：浙江大学 学位授予单位：浙江大学人类核糖核苷酸还原酶的模拟分子对接 [D]. 浙江大学,2012乐安县烤烟生产发展存在的问题及对策研究 [D]. 浙江大学,2011水稻光温敏核不育系的鉴定及合风对育性的影响 [D]. 浙江大学,2005水稻基因组中的假基因研究 [D]. 浙江大学,2005水稻和拟南芥MADS和MYB转录因子密码子用法及系统进化分析 [D]. 浙江大学,2005水稻单倍体染色体加倍及不同倍性植株茎解剖结构比较研究 [D]. 浙江大学,2006应用微卫星标记研究中国水稻主栽品种的遗传变异 [D]. 浙江大学,2006水稻三类抗病基因同源物的结构和进化分析 [D]. 浙江大学,2006烤烟烘烤测控系统的设计与实现 [D]. 浙江大学,2006凉山优质烤烟生产规划及配套技术 [D]. 浙江大学,2006
【相似文献】
中国期刊全文数据库
中国优秀硕士学位论文全文数据库
中国博士学位论文全文数据库
中国重要会议论文全文数据库
中国重要报纸全文数据库
中国学术期刊网络出版总库
【文献分类导航】从导航的最底层可以看到与本文研究领域相同的文献，从上层导航可以浏览更多相关领域的文献。
| 
点击下列相关研究机构和相关文献作者，可以直接查到这些机构和作者被《中国知识资源总库》收录的其它文献，使您全面了解该机构和该作者的研究动态和历史。
