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水稻和拟南芥MADS和MYB转录因子密码子用法及系统进化分析  
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【英文题名】 Codon Bias and Phylogenetics Analysis of MADS and MYB Transcription Factors in Rice and Arabidopsis
【作者】 李娟;
【导师】 薛庆中;
【学位授予单位】 浙江大学;
【学科专业名称】 生物信息学
【学位年度】 2005
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 浙江大学
【网络出版投稿时间】 2005-10-10
【基金】 国家自然科学基金
【关键词】 水稻; 拟南芥; MYB转录因子; MADS转录因子; 密码子偏性; 多序列比对; 结构域; 系统进化分析;
【英文关键词】 Arabidopsis thaliana; Rice; MYB transcriptional factors; MADS transcriptional factors; codon usage bias; domain; Multisequences alignment; Phylogenetics analysis;
【中文摘要】 该论文比较了水稻和拟南芥全基因组MYB和MADS两转录因子的密码子用法偏性, 阐述了他们的结构特点、并作了系统进化分析;所得结果将有助于对植物转录因子的相互作 用及基因表达和调控方式的深入探讨,在作物育种上也有潜在价值。 1、植物转录因子的研究进展 植物各种诱导型基因的表达主要受特定转录因子在转录水平上的调控。典型的转录因子 含有DNA结合区、转录调控区、寡聚化位点及核定位信号专区等功能区域。本文简要介绍 转录因子的概念、结构及分类。同时分别介绍了MYB和MADS两转录因子的研究概况。 2、拟南芥及水稻转录因子MADS密码子的偏好性比较 大多数与花发育相关的功能基因属于MADS基因家族。应用CodonW的因子分析表明, 拟南芥MADS转录因子家族偏好使用A、U结尾的密码子,而水稻MADS转录因子家族偏 好使用G、C结尾的密码子。同时通过氨基酸序列的多重比对表明密码子偏好性与氨基酸序 ...
【英文摘要】 Genome -wide comparisons of MYB and MADS transcriptional factor on codon bias are made in Arabidopsis and Rice. The results obtained by using the structure and phylogenetics analysis of both the transcription factors will be helpful to investigate their interaction between different genes and gene expression and regulation, and also will be potential in the crop breeding.1. The reaching developmant of transcription factors in plantThe inducing genes are controlled mainly by transcription factors at the tran...
【更新日期】 2005-12-16

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