| 
  中国优秀硕士学位论文全文数据库
  关闭
水稻基因组中的假基因研究  
   在线阅读　整本下载　分章下载　分页下载本系统暂不支持迅雷或FlashGet等下载工具
【英文题名】 Research on Pseudogenes in Rice Genome
【作者】 黄志华;
【导师】 薛庆中;
【学位授予单位】 浙江大学;
【学科专业名称】 作物遗传育种
【学位年度】 2005
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 浙江大学
【网络出版投稿时间】 2005-07-22
【基金】 国家自然科学基金
【关键词】 水稻; 基因组; 假基因; 生物信息学; 进化;
【英文关键词】 rice; pseudogene; genome; bioinfomatics; evolution;
【中文摘要】 水稻是世界上最重要的粮食作物之一,是第一个完成全基因组序列框架图测序的作物。假基因(pseudogene)是目前基因组学的研究热点,指在聚因组中那些与已知功能基因序列高度相似,但是缺乏编码蛋白功能的DNA序列。假基因保留了远古基因的信息,被视为基因组进化中的分子化石,成为研究生物进化和动态基因组的重要线索。利用假基因对水稻基因组进行研究,会揭示水稻更多的生物和遗传特性,了解水稻基因组在进化过程中基因复制、突变以及DNA替换、插入、缺失等遗传事件的机制,为水稻的生产提供更多的科学指导。 利用同源性搜索,我们可以得到大量假基因在水稻基因组中的分布信息。通常的步骤为基因组序列的获取、六框翻译比对、FASTA程序重新联配、去除冗余基因、合并已知假基因、筛选加工假基因和非加工假基因;对上述结果可以进行假基因的群体特性,染色体分布,同源家族、GC含量分布、序列长度分布、Ka/Ks比、基因和假基因进化、物种亲缘关系比较、DNA突变机制等一系列分析。在研究过程中,我们使用了BLAST、FASTA、CLUSTAL、GO、SIM4、PAML等工具软件,并使用Bioperl开发了一系列似基因序列分析的程...
【英文摘要】 Rice is one of the most important plant of the world which whole genome sequence has been completed. Pseudogenes are sequences of genomic DNA with such similarity to normal genes that they are regarded as non-functional copies or close relatives of genes. It is one hotspot in genome research. Pseudogene is regarded as biologic fossil in genome evolution and key in research of biologic evolution and dynamic genome because it keeps information of ancient genes. More biology and genetic characters of rice will...
【更新日期】 2005-10-14

【相同导师文献】

导师：薛庆中    导师单位：浙江大学    学位授予单位：浙江大学
[1] 李禹.人类核糖核苷酸还原酶的模拟分子对接[D]. 浙江大学,2012
[2] 杨国辉.乐安县烤烟生产发展存在的问题及对策研究[D]. 浙江大学,2011
[3] 周忠静.水稻光温敏核不育系的鉴定及合风对育性的影响[D]. 浙江大学,2005
[4] 黄志华.水稻基因组中的假基因研究[D]. 浙江大学,2005
[5] 李娟.水稻和拟南芥MADS和MYB转录因子密码子用法及系统进化分析[D]. 浙江大学,2005
[6] 金亮.水稻单倍体染色体加倍及不同倍性植株茎解剖结构比较研究[D]. 浙江大学,2006
[7] 应杰政.应用微卫星标记研究中国水稻主栽品种的遗传变异[D]. 浙江大学,2006
[8] 王庭璋.水稻三类抗病基因同源物的结构和进化分析[D]. 浙江大学,2006
[9] 王胜雷.烤烟烘烤测控系统的设计与实现[D]. 浙江大学,2006
[10] 刘先超.凉山优质烤烟生产规划及配套技术[D]. 浙江大学,2006
xxx
【读者推荐文章】中国期刊全文数据库 中国重要报纸全文数据库 中国博士学位论文全文数据库 中国优秀硕士学位论文全文数据库 中国重要会议论文全文数据库
【相似文献】
中国期刊全文数据库
中国优秀硕士学位论文全文数据库
中国博士学位论文全文数据库
中国重要会议论文全文数据库
中国重要报纸全文数据库
中国学术期刊网络出版总库
点击下列相关研究机构和相关文献作者，可以直接查到这些机构和作者被《中国知识资源总库》收录的其它文献，使您全面了解该机构和该作者的研究动态和历史。
【文献分类导航】从导航的最底层可以看到与本文研究领域相同的文献，从上层导航可以浏览更多相关领域的文献。

农业科学
　 农作物
　　 禾谷类作物
　　　 稻
  
 
  CNKI系列数据库编辑出版及版权所有：中国学术期刊(光盘版)电子杂志社
中国知网技术服务及网站系统软件版权所有：清华同方知网(北京)技术有限公司
其它数据库版权所有：各数据库编辑出版单位（见各库版权信息）
京ICP证040431号    互联网出版许可证 新出网证（京）字008号