【英文题名】
Construction of A Suppression Subtractive Hybridization Library for Red Skin Mutant of 'Zaosu' Pear and Expressed Sequence Tag Analysis
【作者】
刘亚杰 ;
【导师】
徐凌飞 ;
【学位授予单位】
西北农林科技大学 ;
【学科专业名称】
果树学
【学位年度】
2011
【论文级别】
硕士
【网络出版投稿人】
西北农林科技大学
【网络出版投稿时间】
2011-12-27
【关键词】
梨 ;
红皮芽变 ;
抑制消减杂交 ;
表达序列标签 ;
【英文关键词】
Pear ;
Red skin mutant ;
Suppression subtractive hybridization ;
Expressed sequence tags ;
【中文摘要】
红皮梨育种是国内外梨育种的一个主要目标。与梨果实红皮性状形成的相关基因的分离和鉴定是红皮梨分子育种的基础。本研究以特有的早酥梨红皮芽变及其母株为材料,利用抑制消减杂交(Suppression subtractive hybridization, SSH)技术构建消减cDNA文库,筛选差异表达克隆,进行序列测定,对差异表达基因进行鉴定和功能分析,主要研究结果如下:
1.以早酥梨红皮芽变和母株果实为试验材料,以芽变果实为试验方(tester),早酥梨果实为驱动方(driver),利用抑制性消减杂交(Suppression Subtractive Hybridization,SSH)技术构建了消减cDNA文库,从消减文库中挑取了1039个克隆,获得了960个阳性克隆,插入片段长度经PCR鉴定,主要分布于250-1000bp之间。
2.去除污染、重复、低质量(﹤100 bp)的序列后,再进行序列测定,然后在GenBank中进行BLASTX分析比较,有314条特异的基因片段,其中203条(占64.7%)与数据库中已知功能基因有较高的同源性,49条(占15.6%)为功能未知基因,62条(占19.7%)比对...
【英文摘要】
Red pear breeding is one of the major domestic and international pear breeding projects. Separation and identification about red skin development-related genes is the basic molecular breeding.In this experiment, red mutant of‘Zaosu’and its mother plant were used as the materials, we construct a subtracted cDNA library by the suppression subtractive hybridization (SSH)method.we got differentially expressed clonings and sequenced. These differentially expressed genes were identified and functional analysis. M...
【更新日期】
2012-02-08
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