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林麝、马麝SRY基因的克隆与编码蛋白质的结构、功能预测及其在系统进化分析中的应用  
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【英文题名】 Cloning of SRY Gene from Moschus Berezovskii and Moschus Chrysogaster and the Prediction and Analysis of SRY Protein's Structure and Its Application in Phylogenetic Analysis
【作者】 张亮;
【导师】 岳碧松;
【学位授予单位】 四川大学;
【学科专业名称】 生态学
【学位年度】 2004
【论文级别】 硕士
【网络出版投稿人】 四川大学
【网络出版投稿时间】 2005-01-05
【关键词】 林麝; 马麝; SRY基因克隆与分析; 系统进化; 父系遗传;
【英文关键词】 Moschus berezovskii; Moschus chrysogaster; SRY cloning and analysis; Phylogeny; Paternal inheritance;
【中文摘要】 根据已报道的偶蹄目动物并参照人和狗SRY基因碱基序列设计一对简并引物,以林麝(Moschus berezovskii)及马麝(Moschus chrysogaster)基因组DNA为模板,通过PCR分别扩增出SRY基因HMG-box及其CDS区。克隆的林麝及马麝SRY基因片段经测序,其长度分别为187bp和684bp。 根据得到的林麝及马麝SRY基因CDS区核苷酸序列翻译成氨基酸序列,对这段编码氨基酸序列进行分析,发现在林麝及马麝两个种间比较,HMG-box区存在较高的异义突变,提示其受到一定程度种特异性的适应选择(正选择)。CDS区4个异义突变就有3个发生在HMG-box区域,该区域异义突变远高于其侧翼序列,这是值得重视的。 对SRY基因编码蛋白质进行了一级结构、二级结构分析和三维空间构象的预测。将其与NCBI数据库中人及小鼠的SRY蛋白质三维结构对比,构象基本一致。对SRY蛋白从组成、性质、功能、结构域及空间构象等角度进行了分析,同时重点讨论其中的HMG-box区,从多方面讨论和认识了该蛋白。认为该林麝及马麝的SRY蛋白是亲水性蛋白,无信号肽,无跨膜...
【英文摘要】 CDS region of SRY gene were cloned from M. berezovskii and M. chrysogaster genomic DNA by PCR method with primers according to the known SRY sequences from Artiodactyla animals.The nucleotides sequences of SRY CDS were translated into amino acid sequences and were analyzed using softwares. It was found that there have a high nonsynonymous sbustitutions in HMG-box region between the M. berezovskii and M. chrysogaster, which suggested that in some degree the HMG-box is affected by the positive directional sel...

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