【英文题名】
SNP Markers Screening and Application in Genetic Polymorphism of Citrus
【作者】
魏召新 ;
【导师】
钟广炎 ;
【学位授予单位】
西南大学 ;
【学科专业名称】
果树学
【学位年度】
2010
【论文级别】
硕士
【网络出版投稿人】
西南大学
【网络出版投稿时间】
2010-07-09
【关键词】
柑橘 ;
单核苷酸多态性 ;
单链构象多态性 ;
【英文关键词】
Citrus ;
single nucleo tide polymorphism ;
Single-strand conformation polymorphism ;
【中文摘要】
柑橘作为世界上重要的果树树种之一,有着重要的生产和科研价值。但由于柑橘种属间易杂交、芽变频率高和栽培历史悠久等原因,导致柑橘种属间亲缘关系复杂,分类系统至今未有定论。开发利用分子标记对柑橘类果树的多态性进行评价,有可能为该问题提供解决途径。
单核苷酸多态性是由单个碱基变异引起的DNA序列多态性,是第三代遗传标记物。单核苷酸变异发生位置多、频率高、稳定性好,适合规模化分析。开发利用单核苷酸多态性分子标记,可以对柑橘的种质资源进行多态性评价,可以探讨柑橘种属间的分类进化关系,还以用于基因作图及整合作图、还可以研究基因功能、进行分子标记辅助育种等。因此,单核苷酸多态性标记对于柑橘的遗传与育种具有重要的理论和实际应用价值,应用前景广阔。
在本论文中,以38个柑橘及其近缘属植物为材料,利用PCR-SSCP方法筛选分析SNP分子标记,从84对引物中筛选出了有多态性PCR产物的引物18对,并对其中10对引物的PCR产物进行了克隆测序,共得到157个SNP位点,包括一个14碱基的InDel位点,这些位点多为二等位性,仅6个SNP位点是三等位性。对PCR-SSCP的谱带分型、测序的结果进行...
【英文摘要】
Citrus, as one of the most important fruit trees, have important values in food production and scientific researches. However, citrus phylogenetic relationships are complicated by their being able to cross easily between species and even between genera, high mutation rate and long history of cultivation. For these reasons, citrus classification system is still under debate. One of the possible ways to solve this issue is to develop and use single nucleotide polymorphism markers to evaluate the polym...
【更新日期】
2010-08-12
【相同导师文献】
导师:钟广炎 导师单位:西南大学 学位授予单位:西南大学
[1] 王萱.甜橙乙烯诱导酯酶基因家族的进化和表达分析 [D]. 西南大学,2014
[2] 曹继容.柑橘叶片离子组及其对黄龙病病原菌侵染的响应 [D]. 西南大学,2014
[3] 淳长品.土壤砷铅汞胁迫对脐橙生长和重金属累积的影响 [D]. 西南大学,2009
[4] 魏召新.柑橘单核苷酸多态性分子标记的筛选及其在遗传多样性研究中的应用 [D]. 西南大学,2010
[5] 阳佳位.柑橘衰退病RNAi载体构建、遗传转化与转基因植株的评价 [D]. 西南大学,2010
[6] 李翀.应用SNP标记区分云南瑞丽野生枸橼个体和柚SNP标记开发初探 [D]. 西南大学,2011
[7] 曾培.单核苷酸多态性分子标记在柑橘杂种区分中的应用 [D]. 西南大学,2011
[8] 叶庆亮.岩溪晚芦成熟果皮与果肉差减cDNA文库的构建及初步分析 [D]. 西南大学,2008
[9] 谈安群.柑桔叶片干旱胁迫抑制差减cDNA文库的构建与初步分析 [D]. 西南大学,2008
[10] 闫虎斌.柑桔衰退病RNAi/PTGS载体的构建及转化酸橙研究 [D]. 西南大学,2008
【相似文献】
中国期刊全文数据库
中国优秀硕士学位论文全文数据库
中国博士学位论文全文数据库
中国重要会议论文全文数据库
中国重要报纸全文数据库
中国学术期刊网络出版总库
点击下列相关研究机构和相关文献作者,可以直接查到这些机构和作者被《中国知识资源总库》收录的其它文献,使您全面了解该机构和该作者的研究动态和历史。
【文献分类导航】从导航的最底层可以看到与本文研究领域相同的文献,从上层导航可以浏览更多相关领域的文献。