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口蹄疫病毒China/99基因组RNA序列测定及比较分析
 
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【作者】
张显升
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刘在新
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赵启组
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常惠芸
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谢庆阁
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【作者单位】
中国农业科学院兰州兽医研究所病毒室
;
中国农业科学院兰州兽医研究所病毒室 兰州
;
【文献出处】
中国科学(C辑:生命科学)
,
Science in China,Ser.C
,
编辑部邮箱
2003年 05期
期刊荣誉:中文核心期刊要目总览 ASPT来源刊 CJFD收录刊
【中文关键词】
口蹄疫病毒
;
China/99
;
参考毒株
;
基因组
;
序列分析
;
【摘要】
测定了1999年我国口蹄疫流行毒株(China/99,Tibet)基因组全序列,China/99基因组RNA全长8173个核苷酸(nt),开放阅读框含盖6999nt,编码2332个氨基酸的聚合蛋白。5’和3’非翻译区(UTR)分别长1081和93nt.China/99与12株参考株基因组序列比较发现:China/99与英国2001年流行毒、海南和西藏1999年流行毒Id基因的序列同源性高达97%以上,均属泛亚毒株;在牛和猪FMDV的功能未知区、p2和p3区存在较为显著的核苷酸序列差异,3a基因最为显著;l,1a,1b,2a,2c,3b和3d基因没有核苷酸缺失或插入现象,属于病毒必需基因;口蹄疫病毒S片段、功能未知区和内部核糖体进入位点(IRES)二级结构均可分为3种类型。S片段和3’UTR折叠成一个三叶草类似结构。
【基金】
国家“973”资助项目(批准号:G1999011901)
【分类号】
S852.65
【正文快照】
口蹄疫病毒(foot一and一mouth disease virus,FMDv)属于小RNA病毒科口蹄疫病毒属成员,有7个血清型,型间无交叉反应.FMDv引起偶蹄动物的急性接触性传染病,由于该病常造成巨大经济损失,因此受到国际社会的高度重视.目前,世界上还没有中国FMDv全基因组序列的资料. 完整病毒含有单?
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