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肝癌重要基因群及调控网络的整合生物学研究     在线阅读　整本下载　分章下载　分页下载 本系统暂不支持迅雷或FlashGet等下载工具
【英文题名】 Integrated Biology Analysis Reveal Distinct Gene Classes and Regulatory Networks in Hepatocellular Carcinoma
【作者】 魏霖;
【导师】 顾健人;
【学位授予单位】 复旦大学;
【学科专业名称】 病原生物学
【学位年度】 2011
【论文级别】 博士
【网络出版投稿人】 复旦大学
【网络出版投稿时间】 2015-09-11
【关键词】 肝癌; 基因芯片; 功能注释; microRNA; 分类器;
【英文关键词】 heaptocellular carcinoma; gene microarray; microRNA; classifier;
【中文摘要】 肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是一类恶性程度高、预后差的恶性肿瘤。它的发生发展过程中有多类基因参与,其复杂的分子发病机制预示着HCC是一多病因疾病。我们采用基因芯片和miRNA芯片检测肝癌(C)、癌旁肝(P)和正常肝(N)的mRNA和miRNA的表达谱差异。通过数据库Gene Ontology和KEGG Pathway注释差异的基因和miRNA可能的功能；并分析基因之间或基因与miRNA之间可能的关系,构建相互作用网络。通过分析基因在不同组织中的差异表达、它们参与的生物学过程,以及基因网络中的核心调控基因和效应基因,我们将这些差异归纳为三类基因表达谱型。第一类,相对于正常肝和肝癌组织,仅在癌旁肝组织中差异表达的基因、生物学过程及调控基因和效应基因。其差异表现在免疫反应上调和代谢下调。相关的基因变化表现为,与细胞增殖、细胞凋亡、细胞防御和免疫应答等相关的基因上调；同时,与糖类运输、激素合成和胆汁酸合成等相关的基因下调。核心调控基因是TNXB和COL1A1,核心效应基因是ITGB7。这些变化或许体现了炎症及其导致的细胞死亡和细胞再生。而癌旁中肝脏正常功能的破坏或许是来自于...
【英文摘要】 Hepatocellular carcinoma is one of the highly malignant and lethal cancers in the world. Its complex process of molecular pathogenesis indicated that HCC is caused by multiple etiological factors with the involvement of multiple types of genes during its development and progression.We have performed microarray analysis of mRNA and microRNA (miRNA) to measure the comparative levels of mRNAs and miRNAs in HCC (C), non-cancerous liver (P) and normal liver (N) tissues. After integrating all these results with t...
【更新日期】 2016-01-04

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