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小麦族A、S、D二倍体种全长cDNA文库构建及序列初步分析     在线阅读 整本下载 分章下载 分页下载 本系统暂不支持迅雷或FlashGet等下载工具
【英文题名】 Construction of Full-Length cDNA Libraries of A, S and D Genome in Diploid Species of Triticeae and Primary Analysis of Their Sequences
【作者】 毛新国;
【导师】 贾继增;
【学位授予单位】 中国农业科学院;
【学科专业名称】 生物化学与分子生物学
【学位年度】 2004
【论文级别】 博士
【网络出版投稿人】 中国农业科学院
【网络出版投稿时间】 2004-07-22
【关键词】 基因组供体; 全长cDNA文库; 单核苷酸多态性; 密码子使用偏爱性; 分子进化; 比较基因组学;
【英文关键词】 genome donor; full-length cDNA library; single nucleotide polymorphism (SNPs); codon usage bias; molecular phylogenetics; comparative genomic;
【中文摘要】 普通小麦(T.aestivum)为异源六倍体(AABBDD),基因组庞大(1.6×10~(10)bp),重复序列多(约90%),发掘、克隆小麦新基因意义巨大。全长cDNA文库中绝大多数克隆不仅包含完整的阅读框架,还拥有5′和3′端的非编码区,是进行功能基因组学研究的一条有效途径。 在引进、消化吸收的基础上,我们对Cap-trapper法做了一些具体的改进,形成了一套简单易行的技术体系,建立了我们自己的全长cDNA文库构建技术平台。利用改进的Cap-trapper法,分别构建了乌拉尔图小麦(T.urartu)A基因组,拟斯卑尔脱(Ae.speltoides ssp speltoide)S基因组和粗山羊草(Ae.squarrosa ssp strangulata)D基因组的全长cDNA文库,库容量达到了10~6,重组率超过95%,文库中全长基因的比例分别为70%、89.6%和70%。基因功能注释表明,在得到的2089个基因中,有1584个基因为全长基因,1346个为小麦全长新基因,其中A基因组569个,S基因组有553个,D基因组468个。 密码子使用的偏爱性是...
【英文摘要】 Bread wheat (T.aestivum) is one of the most important crops in the world, yet studies about it lags far behind small genome organisms, such as O. sativa. A. thaliana, etc. Up to date, only a few wheat genes were cloned because of its large genome (1.6 1010bp) and redundant repeat sequences (about 90 % ) . As most of clones from full-length cDNA library contained not only the CDS but also the UTRs of 5' and 3' regions, which facilitate the progress of later researches such as sequencing, structural and funct...

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