节点文献

复杂疾病驱使的融合SDA-SVM集成基因挖掘方法

An ensemble analysis approach by fusion of stepwise discriminant analysis and support vector machine for gene mining

  • 推荐 CAJ下载
  • PDF下载
  • 不支持迅雷等下载工具,请取消加速工具后下载。

【作者】 杨德印李霞郝大鹏张杰张瑞杰饶绍奇

【Author】 YANG De-yin1,LI Xia1,2,3,4*,HAO Da-peng1,ZHANG jie1,ZHANG Rui-jie1,RAO Shao-qi1,5*(1.Department of Bioinformatics,Harbin Medical University Harbin 150086,China;2.Deparment of Computer Science,Harbin Institute of Technology Harbin 150080,China;3.Biomedical Engineering Institute of CUMS Beijing 10004,China;4.College of Biological Science and Technology,Tongji University Shanghai 200092,China;5.Departments of Cardiovascular Medicine and Molecular Cardiology,Cleveland Clinic Foundation Cleveland,Ohio 44195,USA)

【机构】 哈尔滨医科大学生物信息学系哈尔滨医科大学生物信息学系 哈尔滨150086哈尔滨150086哈尔滨工业大学计算机学院哈尔滨150001首都医科大学生物医学工程学院北京100054同济大学生命科学与技术学院上海200092Departments of Cardiovas Cular Medicine and Molecular CardiologyClevel and Clinic Foundation levelandohio44195USA

【摘要】 提出了一种新颖的复杂疾病驱使的融合SDA-SVM(Stepwise Discriminant Analysis-Support Vector Machine,SDA-SVM)技术的集成基因挖掘方法。该集成方法融合逐步判别分析和支持向量机的优点,能够有效地进行复杂疾病相关基因的深度挖掘,使得挖掘出的基因能够较好地识别疾病类型和亚型。通过将该方法应用于一套弥散性大B细胞淋巴瘤DNA表达谱数据,并与其它基因挖掘方法对比,结果表明该方法挖掘出的基因具有较高的疾病相关性和较强的疾病类型识别能力。

【Abstract】 This paper proposes a novel ensemble approach which combines the merits of stepwise discriminant analysis and support vector machine for extracting disease relevant genes and for classifying biological types.By comparing the proposed method with other gene mining methods using a public dataset of the diffuse large b-cell lymphoma,the result demonstrates that the genes extracted by the proposed method have higher disease relevancy and also yield better classification performance.

【基金】 国家自然基金(30170515,30571034和30570424);国家863项目(2003AA2Z2051);黑龙江科技攻关(GB03C602-4);黑龙江自然科学基金(F0177和F2004-02);211工程“十五”建设项目;哈尔滨医科大学研究生创新基金
  • 【文献出处】 生物信息学 ,China Journal of Bioinformatics , 编辑部邮箱 ,2007年01期
  • 【分类号】Q78
  • 【被引频次】4
  • 【下载频次】131
节点文献中: 

本文链接的文献网络图示:

本文的引文网络