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SSR在鸭茅种质资源遗传多样性研究中的应用初探

Primary application of SSR about genetic diversity analysis in Dactylis glomerata germplasm resources

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【作者】 曾兵张新全杨武云兰英

【Author】 ZENG Bing~1,ZHANG Xin-quan~(1*),YANG Wu-yun~2,LAN Ying~3(1.Department of Grassland Science,Sichuan Agricultural University,Sichuan Ya’an 625014,China;2.Crop Research Institute,Sichuan Academy of Agricultural Sciences,Sichuan Chengdu 610066,China;3.Maize Research Institute,Sichuan Agricultural University,Sichuan Ya’an 625014,China)

【机构】 四川农业大学草业科学系四川省农科院作物研究所四川农业大学玉米研究所 四川雅安625014四川雅安625014四川成都610066

【摘要】 本文以鸭茅基因组DNA为模板,利用小麦SSR引物对鸭茅SSR反应体系中的一些重要参数进行摸索和优化实验,建立了一套鸭茅SSR分子标记的最优化反应体系,在15μl体系中,最终浓度或量:Mg2+为2.5 mm/L、dNTP为400μmol/L、Taq酶为1.0U、引物浓度为2.0~2.5μpmol/L、模板NDA量为60~80 ng。同时成功的筛选出20对能较好的应用于鸭茅种质资源遗传多样性研究的SSR引物,可用于鸭茅SSR标记的进一步研究。

【Abstract】 Based on the genomic DNA extracted from Dactylis glomerata and SSR primers of wheat,some essential factors that might affect the result of SSR assay were tested and compared.An optimal reaction system suitable for the assay and usage of SSR in Dactylis glomerata was established.There are 2.5 mm/L Mg2+,400μmol/L DNTP,1.0 U Taq DNA polymerase,2.0-2.5μpmol/ L primer,60-80 ng template DNA in a volume of 15μl amplification reactions system.Twenty SSR primers of wheat were selected,which could be used in Dactylis glomerata.

【关键词】 鸭茅遗传多样性SSR应用
【Key words】 Dactylis glomeratagenetic diversitySSR markerapplication
【基金】 国家自然科学基金项目(30371022)资助
  • 【文献出处】 西南农业学报 ,Southwest China Journal of Agricultural Sciences , 编辑部邮箱 ,2006年06期
  • 【分类号】S543.3
  • 【被引频次】12
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