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直接扩增甜瓜小卫星DNA指纹图谱

Direct Amplification Minisatellite DNA Fingerprinting on Melon(Cucumis melo L)

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【作者】 王掌军王建设刘玲刘生祥陈素生许勇王永健

【Author】 WANG Zhang-jun~(1,2),WANG Jian-she~1,LIU Ling~1,LIU Sheng-xiang~2,CHEN Su-sheng~2,XU Yong~1,WANG Yong-jian~1 (1.National Engineering Research Center for Vegetables,Beijing 100089,China;2.Agricutural College of Ningxia University,Yinchuan 750021,China)

【机构】 国家蔬菜工程技术研究中心宁夏大学农学院国家蔬菜工程技术研究中心 北京100089宁夏银川750021北京100089

【摘要】 以小卫星DNA YNZ22核心序列为引物,甜瓜DNA为模板,在甜瓜上研究了直接扩增小卫星DNA(DAMD)的优化反应体系,结果表明:在20μL的反应体系中,5种主要成分Taq DNA聚合酶、Mg2+、引物、模板DNA和dNTPs的最适浓度分别为1U,2.5 mmol/L,0.5 mmol/L,30 ng,5 mmol/L。在优化的DAMD-PCR反应体系下,利用该引物在28个甜瓜品种上构建了直接扩增小卫星DNA(DAMD)的指纹图谱,分析结果表明,该引物在28个甜瓜品种上共扩增出13位点,其中9位点具有多态性,多态性条带比率为69%,可一次性从28个甜瓜品种中鉴别出其中的21个,鉴别率高达75%。

【Abstract】 The optimal reaction of DAMD(Direct Amplification of Minisatellite DNA by PCR) in melon was studied with a minisatellite primer YNZ22 and melon template DNA.The results showed that the optimum concentration of five important components i.e.Taq DNA polymerase,Mg2+,primer,template DNA and dNTPs in 20 μL reaction system were 1U,2.5 mmol/L,0.5 mmol/L,30 ng,5 mmol/L respectively.The minisatellite DNA fingerprinting of 28 melon cultivars were established by using optimum system with primer YNZ22.The primer could produce 13 bands,and 9 bands were polymorphic bands,the percentage of polymorphic bands(PPB) was 69%.The primer could identify 21 of 28 cultivars at once,its identification rate was 75%.

【关键词】 甜瓜小卫星DNA指纹图谱
【Key words】 Cucumis meloMinisatellite DNAFingerprinting map
【基金】 国家863高科技发展计划项目(2002AA244021);北京市重大科技合同项目(H022020130130)
  • 【文献出处】 华北农学报 ,Acta Agriculturae Boreali-Sinica , 编辑部邮箱 ,2006年03期
  • 【分类号】S652
  • 【被引频次】7
  • 【下载频次】177
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