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利用正交设计优化白桦的SSR-PCR反应体系
Optimization of SSR-PCR System for Betula platyphylla Using Orthogonal Design
【摘要】 利用正交设计L16(45)对白桦SSR-PCR反应体系的5因素(Taq酶,Mg2+,模板DNA,dNTP,引物)在4个水平上进行优化试验,筛选出各反应因素的最佳水平,建立了白桦SSR-PCR反应的最佳体系(20μL):DNA100ng,Mg2+浓度为3mmol·L-1,Taq酶0.5U,dNTP浓度为0.5mmol·L-1,引物浓度为0.4μmol·L-1。对白桦SSR-PCR最佳反应体系进行了梯度退火温度,得到的最佳退火温度为59.9℃。
【Abstract】 Orthogonal design was used to optimize SSR-PCR amplification system for Betula platyphylla in terms of five factors (Taq DNA polymerase, Mg 2+, DNA template, dNTP and primer) from four levels. An optimal SSR-PCR system for Betula platyphylla was obtained as 100ng DNA template, 3mmol· L -1 Mg 2+, 0.5U Taq DNA polymerase, 0.5mmol· L -1 dNTP, 0.4μmol·L -1 primer for 20μL reaction system. The optimal annealing temperature for SSR-PCR reaction system is determined as 59.9℃ by gradient PCR.
【Key words】 Betula platyphylla Suk.; SSR markers; Reaction system; Orthogonal design;
- 【文献出处】 东北林业大学学报 ,Journal of Northeast Forestry University , 编辑部邮箱 ,2006年06期
- 【分类号】S792.153
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