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萘降解质粒pND6-1中萘趋化基因nahY的克隆和核苷酸序列分析

CLONING AND NUCLEOTIDE SEQUENCE ANALYSIS OF NAPHTHALENE CHEMOTAXIS GENE nahY IN NAPHTHALENE-DEGRADING PLASMID pND6-1

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【作者】 蔡宝立刘斌马琳王学刚

【Author】 CAI Baoli *, LIU Bin1, MA Lin & WANG Xuegang1 (Institute of Molecular Biology, Nankai University, Tianjin 300071, China) (1 Beijing Genomics Institute, Beijing 101300, China)

【机构】 南开大学分子生物学研究所北京华大基因研究中心北京华大基因研究中心 天津300071北京101300天津300071北京101300

【摘要】 假单胞菌 (Pseudomonas)ND6菌株的萘降解基因位于 10 2kb的质粒 pND6 1上 .以pUC18质粒为载体 ,制备了含有 1.5~ 3 .0kbpND6 1DNA随机片段的基因文库 .通过DNA测序和DNA序列的同源性分析 ,从基因文库中筛选出含有萘趋化基因nahY的克隆 .nahY基因的大小为 16 17bp ,编码的萘趋化蛋白由 5 38个氨基酸组成 ,与假单胞菌G7菌株的nahY基因相比 ,核苷酸序列的同源性是 96 .7% ,编码的氨基酸序列的同源性是 95 % .图 4参 7

【Abstract】 Naphthalene-degrading genes of Pseudomonas sp. strain ND6 were localized to the 102 kb plasmid, pND6-1. Using pUC18 as a vector, a gene library containing 1.5~3.0 kb of DNA fragments from pND6-1 was constructed. By means of sequencing and analogous analysis of DNA fragments cloned, a clone containing naphthalene chemotaxis gene, nahY, was selected. The size of nahY gene from pND6-1 is 1 617 bp, which encodes 538-amino-acid chemotaxis protein. In comparison with nahY of Pseudomonas strain G7, their homology of nucleotide sequences is 96.7% and the homology of amino acid sequences is 95%. Fig 4, Ref 7

  • 【文献出处】 应用与环境生物学报 ,Chinese Journal of Applied and Environmental Biology , 编辑部邮箱 ,2002年06期
  • 【分类号】Q785
  • 【被引频次】9
  • 【下载频次】141
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