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菌落PCR在大规模基因组测序中的应用

Colony PCR Apply to The Rice Genome Sequencing

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【作者】 唐晔盛李英朱静洁胡欣林志新韩斌洪国藩

【Author】 TANG Ye Sheng 1)* , LI Ying 2) , ZHU Jing Jie 2) , HU Xin 2) ,LIN Zhi Xin 1) , HAN Bin 2) ,HONG Guo Fan 2) ( 1) College of Life Science and Biotechnology, Shanghai Jiaotong University, Shanghai 200240, China;

【机构】 上海交通大学生命科学技术学院中国科学院国家基因研究中心中国科学院国家基因研究中心 上海200240上海200233上海200240

【摘要】 一种利用菌落直接PCR扩增DNA并用于测序的实验方法 .通过对引物的设计和菌液浓度控制 ,使PCR反应后的内容物对测序干扰减到最小 .与传统的测序过程比较 ,它省去了抽提模板DNA一步 ,节省了大量时间和实验成本 .另外此方法可对BAC亚克隆库构建时由连接转化过程中导致的假阳性起筛选和鉴定作用 .采用该法成功测定了籼稻 (Oryzasativaindica)广陆矮 4号的L3173号BACDNA全长序列 (约 10 0kb) ,GenBank登录号 :AL5 12 5 42 .

【Abstract】 A method of using colony PCR products to sequence directly by controlling primer design. Less time and cost than the normal way (without DNA extraction and sequencing prior purification). It can also detect the false insert fragments by electrophoreses of the PCR products. One BAC DNA of the Oryza sativa indica 4 th chromosome has been sequenced by this method, the GenBank Accession number: AL512542.

【关键词】 菌落PCR水稻基因组测序
【Key words】 colony PCRrice genomesequencing
  • 【文献出处】 生物化学与生物物理进展 ,Progress In Biochemistry and Biophysics , 编辑部邮箱 ,2002年02期
  • 【分类号】Q523
  • 【被引频次】70
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