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基于ALS抑制剂药效团模型的数据库搜索

3D-database searching based on ALS inhibitors’ pharmacophore model

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【Author】 CHEN Kai, CHENG Yong-hao, YANG Hua-zheng(Institute of Elementa-Organic Chemistry, State Key Laboratory of Elemento-Organic Chemistry, Nankai University, Tianjin 300071, China)

【机构】南开大学元素有机化学研究所元素有机化学国家重点实验室；南开大学元素有机化学研究所元素有机化学国家重点实验室天津 300071；天津 300071；天津 300071；

【摘要】以ALS抑制剂药效团模型为基础建立了提问结构,将药效团模型中的生物结构信息输入到多种小分子三维结构数据库中(NCI-3D和ACD-3D数据库),借助分子三维结构搜索软件(3DFS和ISIS/3D软件)和多种搜索方法(POW-ELL方法和遗传算法)分别搜寻出100多个符合特征结构信息的全新结构候选化合物。这些命中结构的分子特征信息为我们下一步进行分子设计,确定先导化合物结构明确了方向,并提供了重要依据。更多还原

【Abstract】 Derived from the postulated ALS Inhibitors" pharmacophore model, the generalized function-based queries were defined and used for three-dimensional (3D) searching in two different 3D databases (NCI-3D and ACD-3D) . More than 100 novel structural hits were found by performing different 3 D searching program (3DFS and ISIS/3 D) and different conformational searching methods genetic al-gorithm and POWELL method. The novel structure hits provide a lot of structural information for designing and svnthesizing new drug molecular.更多还原

【关键词】 ALS抑制剂；药效团模型；提问结构；三维数据库搜索；候选化合物；
【Key words】 ALS inhibitors； pharmacophore model； queries； 3D - database searching； candidate compounds；

【基金】国家自然科学基金(29972030,29832050)

【文献出处】计算机与应用化学 ,Computers and Applied Chemistry , 编辑部邮箱 ,2002年05期

【分类号】O6-39
【被引频次】3
【下载频次】114

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