肠道病毒71型中国分离株全基因组核苷酸序列分析

【摘要】 全基因组的５个首尾重叠的克隆，并在此基础上进行了全基因组（未包括多聚腺苷酸尾）７４０８个碱基的核苷酸序列测定．数据分析表明，ＳＨＺＨ９８株与其他ＥＶ７１毒株相比，５’ＵＴＲ和３’ＵＴＲ的长度和序列有一定的差异．同源性分析发现，与免疫源性密切相关的Ｐ１结构蛋白基因与台湾流行株的同源性最高，与欧美流行株的同源性较低，Ｐ２，Ｐ３区非结构蛋白基因的同源性与Ｃｏｘｓａｋｉｅｖｉｒｕｓ Ａ１６及ＭＳ，ＢｒＣｒ株较高，而与台湾流行株相比则较低．遗传进化分析发现，ＳＨＺＨ９８株结构蛋白基因与台湾流行株亲缘关系较近，而非结构蛋白基因与Ｃｏｘｓａｋｉｅｖｉｒｕｓ Ａ１６及ＭＳ，ＢｒＣｒ株的亲缘关系较近．上述结果在分子水平上对肠道病毒７１型中国分离株进行分析，并探索了中国分离株的可能进化途径，有助于肠道病毒７１型及整个肠道病毒的基础研究和我国对于ＥＶ７１所致疾病的预防．更多还原