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中国对虾微卫星DNA的筛选

ISOLATING MICROSATELLITE DNA OF CHINESE SHRIMP PENAEUS CHINENSIS

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【作者】 徐鹏周岭华相建海

【Author】 XU Peng,ZHOU Ling Hua,XIANG Jian Hai (Institute of Oceanology,The Chinese Academy of Sciences,Qingdao,266071)

【机构】 中国科学院海洋研究所!青岛266071

【摘要】 于 2 0 0 0年 2月以中国科学院海洋研究所水族楼暂养的中国对虾为材料 ,采用常规方法从尾部肌肉中提取DNA ,构建小片段部分基因组文库。采用人工设计合成的 (CT) 7、(AT) 7重复片段作引物 ,利用PCR法对中国对虾小片段部分基因组文库进行筛选。本实验首次在中国对虾中获得 31个微卫星序列 ,分别分布于 1 8个阳性重组克隆中 ,其中perfect共2 3个 ,占 74% ,imperfect2个 ,占 7% ,compoundperfect 1个 ,占 3% ,compoundimperfect 5个 ,占 1 6%。结果还表明 ,在中国对虾基因组DNA中 ,(CT) n、(AT) n 形式的微卫星序列的含量非常丰富。

【Abstract】 Thirty one microsatellites of the Chinese shrimp Penaeus chinensis were obtained through PCR screening small size fractionated libraries of P. chinensis with simple tandem repeats primers (AT) n and (CT) n. The bacterial suspensions were used in PCR. A high temperature of 95℃ was used for breaking the bacteria. After screening,recombinant positive clones containing microsatellites were sequenced. Among the 31 microsatellites in 18 positive recombinant positive clones are 23 perfect ones (74%),2 imperfect (7%),1 compound perfect (3%),and 5 compound imperfect (16%). The experiment shows that microsatellite sequences characterized by (AT) n and (CT) n abundant in genomic DNA of Chinese shrimp. Primers can be designed according to these microsatellite franking sequences and used in genetic analysis.

【关键词】 中国对虾微卫星筛选
【Key words】 Penaeus chinensisMicrosatelliteScreening
【基金】 国家重点基础研究发展计划项目!资助 ;G1 9990 1 2 0 0 7号;国家自然科学基金!资助项目 ;3 9970 1 1 3号
  • 【文献出处】 海洋与湖沼 ,Oceanologia Et Limnologia Sinica , 编辑部邮箱 ,2001年03期
  • 【分类号】Q75
  • 【被引频次】123
  • 【下载频次】387
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