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丙型肝炎病毒基因变异及候选保守表位分析

Genetic Variation and Conserved Epitopes of Hepatitis C Virus.

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【作者】 黄建生解咏梅任大明

【Author】 HUANG Jian Sheng,XIE Yong Mei, REN Da Ming(State Key Laboratory of Genetic Engineering,Institute of Genetics,Fudan University, Shanghai 200433, China).

【机构】 复旦大学遗传学研究所

【摘要】 HCV分离株主要分为4个基因型(HCVⅠ~Ⅳ),各型间的氨基酸及核苷酸组成同源性均小于80%,氨基酸变异率分别为C8%,E135%,E2/NS153%,NS327%,NS435%,NS539%.不同型别的HCV有不同的地区分布特征.根据HCV表达产物多肽的保守性、亲水性、抗原性及空间构型等特性,已在HCV表达产物中鉴定出一些高度保守的候选B细胞表位及T细胞表位,其中B细胞表位一般为12~40肽,T细胞表位一般为7~9肽,这些B/T细胞保守表位的鉴定,将有助于推动HCV的免疫治疗及疫苗研究的发展.

【Abstract】 Hepatitis C virus has four chief genotypes HCVⅠ、Ⅱ、Ⅲ and Ⅳ,whose homology of amino acids and nucliec acids is less than 80% each other.The variation rates of HCV proteins are core 8%,E1 35%,E2/NS1 53%,NS3 27%,NS4 35%,NS5 39%, respectively . According to the characters of conservation, hydrophilicity, antigenicity and conformation,a series of highly conserved T cell and B cell epitopes are identified from the HCV expressed products ,which might be benificial to the prevention and treatment of hepatitis C.In genenal, B epitope is about 12~40 peptides and T epitope 7~9 peptides .

【关键词】 HCV基因变异保守表位
【Key words】 hepatitis C virus (HCV)genetic variationconserved epitopes
  • 【文献出处】 生物化学与生物物理进展 ,PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS , 编辑部邮箱 ,1999年01期
  • 【分类号】Q939.403
  • 【被引频次】4
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