基于内含子和外显子的系统发育分析的比较

【摘要】 在灵长目动物中分离出 7个断裂基因的内含子和外显子序列 ,分别进行系统发育分析 .比较结果显示 :( 1)基于内含子与基于外显子所得到的进化树的拓扑结构基本一致 ,但由于内含子和外显子序列的突变速率不同 ,导致进化树的分枝长度不同 ;( 2 )在hominoids中 ,外显子的替代速率下降 ,而内含子的替代速率相对稳定 ;( 3)当选用cebus作为参考物种时 ,基于不同外显子推测出的orangutan的分歧时间相差较大 ,而基于不同内含子序列所得的分歧时间比较接近 ,且与化石记录相吻合 ,这说明内含子序列可作为一个更好的“分子钟” ;( 4)对于不同基因 ,序列的G +C含量与它的替代速率有一定关系 ,当内含子的替代速率大于相应的外显子时 ,内含子的G +C含量较低 .所有这些结果显示 ,内含子序列可以用来在近亲缘关系的物种中进行进化分析更多还原