中国蚌类超级条形码与系统发育基因组学

【作者】 黄晓晨； 周春花； 欧阳珊； 吴小平；

【机构】 南昌大学生命科学学院；

【摘要】 物种的准确界定和识别对于理解生物多样性的演变和群落对环境变化的反应至关重要。蚌类是健康淡水生态系统的重要组成,极易受环境变化威胁导致其种群明显衰退。然而,贝壳的形态趋同和表型可塑性使得物种鉴定或存在问题,亟需构建一套经复核凭证标本、形态变异鉴定准确、更加高效的标准DNA参考序列。本研究通过广泛取样,基于基因组浅层测序技术构建包含父系和母系线粒体基因组及nr DNA序列的超级条形码数据集,解决多种基因片段不能互相兼容的弊端;整合贝壳形态对中国蚌类进行物种界定和分类检视。结果显示,基于COI序列的一代DNA条形码,序列差异达到了常用的3%遗传距离阈值标准并不一定能作为划定蚌类有效物种的依据,杂交渐渗和不完全谱系分选现象会影响基于条形码的近缘物种鉴定结果,这需要进一步有效整合基于全面采样的形态变异和核基因组数据,在群体基因组水平探讨分类疑难物种的群体遗传分化式样。研究结果为蚌类物种保护和资源利用提供标准数据和分类鉴定基础。更多还原