基于宏基因组分析的黏菌原生质团微生物组研究

【作者】 彭雪嫣； 李姝； 窦文俊； 亓宝； 王琦； 李玉；

【机构】 吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心； 合肥菌物谷创新研究院；

【摘要】 黏菌是一种具有复杂生活史的原生生物,兼具菌物的孢子繁殖和原生动物运动性的特征。其营养阶段形成的原生质团捕食细菌、真菌和其他微生物。然而与其他类群相比,黏菌内的微生物组成及其功能尚未得到充分的研究。本研究利用宏基因组测序技术,对六种黏菌Didymium squamulosum,D.nigripes,Physarum gyrosum,Badhamia melanospora,Arcyria cinerea和Macbrideola scintillans的原生质团微生物进行分析,旨在探明不同黏菌原生质团内微生物群落组成及其代谢功能差异。通过宏基因组拼接和注释发现,不同种黏菌原生质团中的微生物基因组占总基因组的比例差异显著,从19.88%(D.squamulosum)到78.72%(M.scintillans)不等。细菌是所有黏菌原生质团中最主要的微生物类群(63.24-97.09%),其次是真核生物(0.58-9.18%)、病毒和古菌(0.08-1.23%)。从属级别看,6个黏菌的核心菌群(相对丰度74.55-97.82%)组成相似。物种级别上,6种黏菌原生质团共享的核心细菌占总相对丰度的34.42-66.52%,各物种中特有的细菌仅有0.79-4.54%。表明原生质团对属级水平细菌的选择具有一定的趋同性,但在物种水平上存在宿主特异性。进一步的分析表明,在6种黏菌原生质团中,微生物功能(CAZy、COG、KEGG)组成高度一致,并且具有多种细菌成员行使相同功能的情况,尽管它们在同一功能上的贡献度有所差异。更多还原