贝氏隐孢子虫及其与大肠杆菌共感染对雏鸡肠道菌群的影响

【作者】 黄燕； 陈宇； 米荣升； 左家坤； 韩先干； 刘永杰； 陈兆国；

【机构】 中国农业科学院上海兽医研究所农业部动物寄生虫重点实验室农业部动物产品质量安全生物性危害因子风险评估实验室(上海)； 南京农业大学动物医学院；

【摘要】 贝氏隐孢子虫和禽致病性大肠杆菌皆可寄生于雏鸡呼吸道和消化道黏膜上皮细胞内,为调查贝氏隐孢子虫单独以及与禽致病性大肠杆菌合并感染对雏鸡肠道菌群的影响。方法本试验将1日龄SPF级雏鸡分为隐孢子虫单独感染组(灌胃隐孢子虫1×106个/只)、隐孢子虫和大肠杆菌共感染组(肌注大肠杆菌DE17 2×10~6CFU/只,同时灌胃隐孢子虫1×106个/只)与健康对照组。分别在接种后第3、9、15、21和27天采集新鲜粪样,提取DNA后进行16S rRNA高通量测序及生物信息学分析。结果显示,3组雏鸡肠道微生物有效数据率在0.850以上,丰度最高的优势门厚壁菌门,其次为变形菌门和拟杆菌门;Chao1、Shannon和Simpson三项多样性指数表明,2组感染雏鸡的肠道菌群多样性降低,但隐孢子虫单独感染组较共感染组先恢复;从属水平分析发现,与健康对照组比较,共感染组的乳杆菌属丰度明显降低(P<0.05),而大肠/志贺菌属则显著升高(P<0.05),两者此消彼长。2组感染雏鸡肠道中的布劳特菌属和瘤胃球菌属伴随雏鸡日龄增长呈上升趋势,但相比健康对照组绝对丰度较低。综上,大肠杆菌和贝氏隐孢子虫的共同感染造成雏鸡肠道微生物多样性降低,菌群结构发生变化;大肠杆菌的共感染可加剧隐孢子虫感染造成的雏鸡肠道微生物多样性和菌群结构的变化,这可能与采食量的改变、以及对免疫力和代谢功能的影响有关。更多还原