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火鸡组织滴虫生物功能及潜在致病机制的转录组学分析
【作者】 陈乔光； 戎杰； 陈晨； 王双； 候照峰； 刘丹丹； 陶建平； 许金俊；
【机构】 扬州大学兽医学院； 江苏动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心；
【摘要】 为扩增火鸡组织滴虫基因组信息,本研究将一株体外连续传代的致弱株和一株强毒株进行了转录组测序。制备了标准化cDNA文库并在DNBSEQ平台进行测序,组装并去冗长后得到35914个Unigene,平均长度为1408 bp。将Unigene比对到七大功能数据库,最终分别有26330 (NR:73.31%)、2233 (NT:6.22%)、18410 (SwissProt:51.26%)、17511(KOG:48.76%)、18454 (KEGG:51.38%)、15531 (GO:43.24%)以及23154 (Pfam:64.47%)个Unigene获得功能注释。通过基因本体分析,为深入研究火鸡组织滴虫细胞骨架、代谢、环境适应和致病力差异等提供了生物学依据。总之,从强毒株和弱毒株中收集的基因组信息有助于更好的了解火鸡组织滴虫的分子生物学,为未来新药的开发和疫苗的研制提供理论依据。
【基金】 国家自然科学基金面上项目(31772727);扬州市重点研发计划(现代农业)项目(YZ2017051);江苏高校优势学科建设二期工程基金项目;扬州大学“青蓝工程”基金项目(2018年度);扬州大学专业学位研究生实践创新计划项目(XSJCX18_075)
- 【会议录名称】 2021中国畜牧兽医学会兽医寄生虫学分会第16次学术研讨会论文集
- 【会议名称】2021中国畜牧兽医学会兽医寄生虫学分会第16次学术研讨会
- 【会议时间】2021-04-23
- 【会议地点】中国广东广州
- 【分类号】S852.72
- 【主办单位】中国畜牧兽医学会兽医寄生虫学分会