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基于牛低密度SNP芯片分析我国黄牛品种种间关系和遗传进化
【作者】 张文刚; 吴洋; 张静静; 牛红; 高雪; 张路培; 高会江; 陈燕; 李俊雅;
【机构】 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牛遗传育种创新团队ASTIP-IAS03;
【摘要】 本研究利用Illumina Bovine(26K)和Illumina Bovine(19K)低密度基因分型芯片,检测了6个本地黄牛品种、6个杂交品种和2个培育品种共计848个样本。通过主成分分析(PCA),研究样本大致分为三类:I.浙江黄牛,II.晋南黄牛,III.西门塔尔血统牛。基于Nei’s遗传距离分析,14个中外牛品种的亲缘关系结果与主成分分析结果一致。为进一步证明分析结果的可靠性,本研究中又采用基于模型的群体分析方法,发现在K=3时样本明显分成三类群体,这与主成分分析的结果很好吻合。研究结果通过监控品种间分子遗传标记,准确的评定了种质遗传特性和相互间的关系,为我国地方黄牛品种种质资源评价、种质鉴定和培育品种的利用提供了科学依据。
【关键词】 牛低密度基因分型芯片;
主成分分析;
遗传进化;
本地黄牛;
杂交品种;
【基金】 创新工程经费(cxgc-ias-03);农业部物种资源保护(畜禽)项目(F557);国家自然科学基金项目(31372294,31372294);北京市自然科学基金项目(6154032);863计划(2013AA102505-4);中国农业科学院院本级增量业务费(2013ZL031);科技支撑计划(2011BAD28B04)
- 【会议录名称】 中国畜牧兽医学会养牛学分会第八届全国会员代表大会暨2015年学术研讨会论文集
- 【会议名称】中国畜牧兽医学会养牛学分会第八届全国会员代表大会暨2015年学术研讨会
- 【会议时间】2015-04-25
- 【会议地点】中国北京
- 【分类号】S823.81
- 【主办单位】中国畜牧兽医学会养牛学分会