鸭源禽流感病毒A/Duck/Guangxi/2/2000(H5N1)的基因扩增和序列分析

【作者】 王金玲； 步卫东； 林健； 杨龙峰； 赵振华； 刘月焕；

【机构】 内蒙古农业大学动物科学与医学学院； 北京市农林科学院畜牧兽医研究所； 中国农业大学动物医学院；

【摘要】 用无特定病原(SPF)鸡胚增殖禽流感病毒鸭源分离株A/Duck/Guangxi/2/2000(H5N1),Trizol试剂提取鸡胚尿囊液中的病毒基因组总RNA,利用禽流感病毒8段基因的特异性引物,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术分别扩增该病毒8个基因片段的cDNA。扩增出8段基因的全序列,经纯化回收后测序,进行序列分析。结果表明:A/Duck/Guangxi/2/2000(H5N1)病毒是H5N1亚型高致病力禽流感病毒。其HA基因与1999年和2000年的香港分离毒株的高度同源,说明它们起源于同一种系。A/Duck/Guangxi/2/2000(H5N1)毒株与GSHK3014.8/00(H5N1)毒株NS基因的238位核苷酸到252位核苷酸均缺失,且二者有高同源率。A/Duck/Guangxi/2/2000(H5N1)毒株的NS基因与1997年香港毒株(包括人源毒株)也有较高同源性,说明它们位于同一个基因群系。更多还原