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适用于棉花品种鉴别的核心KASP标记开发及其应用
【作者】 黄龙雨; 吴玉珍; 周大云; 赵兰杰; 单峰; 陈丽婷; 王淼; 匡猛;
【机构】 中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室郑州大学研究基地;
【摘要】 随着测序技术的不断发展,棉花基因组图谱日益完善,高通量的SNP检测技术在棉花品种鉴定及分子辅助育种等方面展现了广阔的发展和应用前景。本研究基于棉花现有的CottonSNP63K和CottonSNP80K两款芯片产品,利用有代表性的材料进行SNP位点的全基因组扫描分析与综合评估,共得到了3 094个具有单拷贝、多态性高、染色体分布均匀的SNP位点。利用82份核心种质的10x重测序结果进一步分析筛选,获得318个候选位点,采用KrakenTM软件成功转化了246个KASP标记。综合考虑分型效果、检测效率及检测成本,最终优选出适用于棉花品种身份鉴别的78个核心KASP标记组合。利用SNPline平台实现了对大量样品的高通量基因分型,为SNP标记技术在棉花品种鉴定及分子标记辅助选择育种等方面的应用奠定了基础。
- 【会议录名称】 中国农学会棉花分会40年征文暨2019年年会论文汇编
- 【会议名称】中国农学会棉花分会40年征文暨2019年年会
- 【会议时间】2019-08-08
- 【会议地点】中国北京
- 【分类号】S562
- 【主办单位】中国农学会棉花分会