食用菌病毒多样性分析及新病毒的鉴定

【作者】 王鑫； 李华平； 李鹏飞；

【机构】 华南农业大学植物保护学院；

【摘要】 食用菌产业是我国继粮食、果品、蔬菜之后的第四大农业产业,然而食用菌病毒引起的病害在生产中时有发生,严重时可造成10%～15%的减产,阻碍了食用菌产业的健康和可持续发展。为了丰富对食用菌病毒多样性的认知以及后期有效开展食用菌病毒防治及致病机制的研究,对购买的金针菇、香菇、鸡腿菇、平菇等100多个食用菌菌株基于宏转录组测序技术进行病毒鉴定分析,将测序获得的Contigs序列与NR库进行Blast x比对分析,比对到165个不同病毒序列,其中dsRNA病毒主要包括Partividae科和其他未分类的dsRNA病毒,正单链RNA病毒有Mitoviridae和Tymovirdae和其他未分类的+ssRNA病毒。根据Blast的结果,选取了7个与已知病毒病毒同源性低于75%、高覆盖率的Contigs (Contig9428、Contig88246、Contig636、Contig2201、Contig27286、Contig2093和Contig7515)。Contig9428与Heterobasidion partitivirus 12同源性为58.78%、Contig88246与Heterobasidion partitivirus 3同源性为55.95%、Contig636与Agaricus bisporus virus 9同源性为47%、Contig2201与Thelephora terrestris virus 1同源性为48%、Contig 27286与Raphanus sativus cryptic virus 1同源性为65%、Contig2093与Macrophomina phaseolina hypovirus 1同源性为54%、Contig7515与Fusarium solani partitivirus 2同源性为70%。对这7个Contigs设计特异性引物进行RT-PCR扩增以此确定带毒菌株,在鸡腿菇菌株JZB2108012中鉴定到Contig27286和Contig88246;在平菇菌株PGK3和SLK3中鉴定到Contig636;在平菇菌株P7350中鉴定到Contig9428;在金针菇菌株HJ55和SJHe-1中鉴定到Contig2201。然后提取这些菌株的dsRNA,在7个食用菌菌株中可以提取到一条或多条dsRNA。通过病毒基因组随机引物和特异引物cDNA克隆,获得了这些新病毒的中间序列,随后用RACE进行病毒序列的末端克隆。关于这些病毒对宿主菌株的生物学特性的影响还在进一步的研究中。更多还原