多位点序列分型法揭示中国甘蔗白叶病植原体存在ST1和ST2两个种群

【作者】 张荣跃； 王晓燕； 单红丽； 李婕； 李银煳； 黄应昆；

【机构】 云南省农业科学院甘蔗研究所云南省甘蔗遗传改良重点实验室；

【摘要】 由植原体引起的甘蔗白叶病是甘蔗的毁灭性病害。本文中笔者建立了一个基于7个管家基因(dnaK、tuf、secY、gyrB、secA、recA、hflB)的多位点序列分型方法用于甘蔗白叶病植原体的遗传多样性和种群结构研究。使用该分型方法分析了来自中国白叶病发生区域的87个样本,共鉴定出2个序列型(ST型),其中ST1型分布最为广泛,是主要的ST型,ST2型仅在中国保山地区发现。种群结构分析表明ST1种群和ST2种群为完全分化的两个种群。7个管家基因的核苷酸多样性在0～0.002 68,表明中国甘蔗白叶病植原体遗传多样性非常低。甘蔗白叶病植原体和甘蔗草苗病植原体16S rRNA基因序列一致性大于99.6%,7个管家基因串联序列一致性大于99%。鉴于甘蔗白叶病植原体和甘蔗草苗病植原体具有相同的寄主、症状、传播介体和极高的核苷酸序列一致性,笔者认为甘蔗白叶病植原体和甘蔗草苗病植原体属于同一种植原体。更多还原