肝螺杆菌感染BALB/c小鼠肠道菌群结构分析

【作者】 冯洁； 张泉； 曹舒扬； 谢建云； 高崧； 高诚；

【机构】 上海实验动物研究中心上海市实验动物质量监督检验站； 扬州大学兽医学院；

【摘要】 目的探讨肝螺杆菌感染小鼠后肠道菌群的结构差异。方法采用Illumina高通量测序技术测定肝螺杆菌感染小鼠肠道细菌16S rDNA基因V4-V5可变区序列,进行操作分类单元(OTUs)聚类、多样性、群落结构组成及差异性分析和代谢功能预测。结果实验组肠道菌群多样性显著低于对照组。实验组和对照组OTU数目分别为89和209,两组共有73个OTU。在门水平,两组菌群序列均分属于7个菌门,两组样本中拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes)均为丰度最高的两个门。在属水平,两组样本共检测到74个属,实验组样本隶属45个属,对照组样本隶属64个属,两组共有35个属,实验组独有10个属,对照组独有29个属,实验组拟杆菌属、Muribaculaceae、毛螺菌属、布劳特菌属(Blautia)、Rumini clostridium等含量相对较高。有31个属存在显著性差异,实验组拟杆菌属、梭菌属、黄杆菌属、瘤胃球菌属、克雷伯菌属、肠球菌属和螺杆菌属等的丰度显著高于对照组,而毛螺菌科NK4A136group、颤螺旋菌属、普雷沃菌属、肠杆菌属、理研菌科RC9gutgroup丰度则显著低于对照组。结论肝螺杆菌感染可引起小鼠肠道菌群的群落丰富度和多样性明显降低,为揭示肝螺杆菌与宿主肠道菌群的调控机制提供依据。更多还原