SAMD12基因内含子区一新的五核苷酸(TTTGA)重复扩增插入导致家族性皮质肌阵挛性震颤癫痫1型

【作者】 岑志栋； 陈思； 陈悠； 陈欣辉； 杨德壕； 王昊天； 罗巍；

【机构】 浙江大学医学院附属第二医院神经内科；

【摘要】 目的:家族性皮质肌阵挛性震颤癫痫(familial cortical myoclonic tremor with epilepsy,FCMTE)是一以皮质震颤和癫痫发作为主要临床特征的常染色体显性遗传神经变性疾病。位于3个不同基因(SAMD12,TNRC6A和RAPGEF2)内含子区的(TTTCA)五核苷酸重复扩增插入在78个日本和中国FCMTE家系被报道并确认为该病的致病突变。然而,在我们前期报道中,(TITCA)五核苷酸重复扩增插入在大多数FCMTE(18/21)被检测到,但仍有部分家系为阴性,提示存在新的致病突变。本报道在一个未检测到(TTTCA)五核苷酸重复扩增插入FCMTE家系发现了新的致病突变。方法:纳入本研究的家系在前期SAMD12,TNRC6A和RAPGEF2基因(TTTCA)的重复引物PCR (Repeat-primed PCR)中均为阴性。重复引物PCR、长片段PCR (long-range PCR) Sanger测序被应用于该家系以确认候选致病基因突变。基于PacBio RSⅡ测序平台的目标区域长读长测序被应用以确认新致病突变的具体结构。结果:在该FCMTE家系发现SAMD12基因内含子区一个新的五核苷酸(TTTGA)重复扩增插入与疾病共分离。对该家系内两名患者(Ⅱ:6和Ⅲ:4)、一名无症状突变携带者(IV:2)以及一个之前报道过携带(TTTCA)五核苷酸重复扩增插入的FCMTE患者(P-Ⅰ-Ⅲ2,作为阳性对照)进行目标区域长读长测序,分别获得了302条、159条、207条和50条跨过重复序列区且准确度大于90%的subreads。经过统计分析结构该家系的重复扩增突变详细结构为:(TTTTA)114-124(TTTGA)108-116,同时P-Ⅰ-Ⅲ2的重复扩增突变详细结构为:(TTTTA)38(TTTCA)479。结论:目标区域长读长测序准确解析了(TTTGA)和(TTTCA)重复扩增插入突变的详细结构。我们的发现进一步扩大了SADM12基因相关FCMTE的突变谱系,提示在(TTTCA)重复扩增插入检测阴性的情况下,还要关注可能存在的其他重复序列扩增插入,如(TTTGA)。更多还原