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杧果E2F/DP转录因子家族生物信息学分析及鉴定
【作者】 高庆远； 孙宇； 刘志鑫； 蒲金基； 杨石有； 张贺；
【机构】 海南大学林学院； 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室；
【摘要】 E2F/DP转录因子是真核生物中细胞周期进程的关键调节因子,与植物激素共同发挥着重要的调控作用。以杧果全基因组为供试参考基因组,鉴定到8个E2F/DP转录因子。本研究预测发现所鉴定的基因都具有相应分组的保守结构域,且蛋白质二级结构相似。分析保守基序,发现杧果有1个高度保守的基序Motif1。基于杧果和大豆、烟草、毛果杨、拟南芥、阿月浑子、葡萄的E2F/DP基因蛋白质序列构建系统发育树,发现杧果E2F/DP基因与阿月浑子、葡萄亲缘关系接近;杧果细菌性黑斑病菌(Xanthomonas campestris pv.mangiferaeindicae,Xcm)和胶孢炭疽菌(Colletotrichum gloeosporioides,Cg)侵染过程中,MiE2F4、MiE2F5、MiE2F6的表达量显著上调。茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)胁迫处理下,MiE2F7表达量显著上调,其余基因均下调,水杨酸(salicylic acid,SA)胁迫处理下,从6h开始,各个基因的表达量都在逐步上调。以上研究结果,可为探究杧果E2F/DP基因参与的植物防御反应机制奠定基础。
【关键词】 杧果；
E2F/DP转录因子；
生物信息学；
【基金】 国家重点研发专项(2019YFD1001103;2019YFD1000504),优质晚熟杧果新品种选育及其配套技术研究与应用,黔科合支撑[2018] 2284;中国热带农业科学院基本科研业务费专项资金(1630042017019);“杧果病虫害监测与防治项目”
- 【会议录名称】 植物病理科技创新与绿色防控——中国植物病理学会2021年学术年会论文集
- 【会议名称】中国植物病理学会2021年学术年会
- 【会议时间】2021-12-11
- 【会议地点】中国贵州贵阳
- 【分类号】S667.7
- 【主办单位】中国植物病理学会