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不同致病力棉花黄萎病菌CAZymes的比较分析
【机构】 植物病虫害生物学国家重点实验室中国农业科学院植物保护研究所；
【摘要】 通过生物信息学的方法,研究棉花黄萎病菌强致病落叶型菌系Vd991和弱致病落叶型菌系Vd250中差异蛋白的碳水化合物酶类CAZymes,进一步为研究棉花黄萎病的致病机理提供理论依据。利用label-free技术,分别对两种病菌的菌丝和菌核的蛋白质进行表达量差异分析,筛选出差异蛋白,按照CAZymes数据库家族功能进行分类注释,分析和比较菌株Vd991和菌株Vd250的菌丝(菌核)CAZymes在各个家族的差异。根据CAZymes注释与分析表明,在菌丝的差异蛋白中,Vd250相比Vd991编码的果胶、纤维素、半纤维素降解酶类的数量都发生了扩增,Vd991对比Vd250只有编码淀粉降解酶的数量发生了扩增;在菌核的差异蛋白中,Vd991对比Vd250在半纤维素降解酶类的数量发生了扩增,编码果胶降解酶类的数量少于Vd250,两种菌编码纤维素降解酶类的数量都只发现了2个,Vd250和Vd991编码CAZymes的数量差异性较小。此外还发现在差异蛋白中,GH家族在各类分解酶中占着主要的地位,PL家族只发现在Vd250中。通过对两种不同致病力菌中差异蛋白的CAZymes比较分析,发现了弱致病非落叶型菌株Vd250和强致病落叶型菌株Vd991编码CAZymes的对比扩增情况,初步得知不同致病力菌的CAZymes家族与病原菌菌核萌发活力的关系,以及与病原菌侵染特性的关系。
【基金】 转基因植物重大专项子课题(2016ZX08005-004-001)
- 【会议录名称】 病虫防护与生物安全——中国植物保护学会2021年学术年会论文集
- 【会议时间】2021-11
- 【分类号】S435.621