rDNA-ITS序列分析法鉴定桑椹菌核病病原

【作者】 曾益春； 危玲； 黄盖群； 刘刚； 殷浩； 郑继川； 姚永权； 王香君； 夏川林；

【机构】 四川省农业科学院蚕业研究所；

【摘要】 本研究采集了四川南充、绵阳、乐山等地果桑园中的真菌12株,通过采用ITS引物扩增并进行测序,上传序列到GenBank进行比对,进一步利用DNAMAN、MEGA 5.0等软件构建进化树,阐明12个真菌样本与已知物种的亲缘关系。试验表明,12种真菌样本扩增出的目的条带为500 bp,通过序列的相似性比对并构建各样本的进化树,J1、J2、J3、J4、J5、J7、J8、J12与桑实杯盘菌(Ciboriashiraiana)的序列相似度最高;J6、J9与小核盘菌(Sclerotiniaminor)的序列相似度最高;J10与肉阜状杯盘菌(Ciboriacarunculoides)的序列相似度最高;J11与桑椹核地杖菌(Scleromitulashiraiana)的序列相似度最高,且序列比对分析结果同传统形态学鉴定结果完全一致。两种方法相结合最终得出结论:J1、J2、J3、J4、J5、J7、J8、J12号菌株为桑实杯盘菌;J6、J9号菌株为小核盘菌;J10号菌株为肉阜状杯盘菌;J11号菌株为桑椹核地杖菌。与传统形态学鉴定法相比,r DNA-ITS序列分析法具有准确度高,不受真菌样本生长情况、地理环境影响等优点,可避免因形态特征掌握不足而导致的不确定性,两种方法相结合在真菌鉴定中会有更广泛、更深入的应用。更多还原