基于EST数据开发柞蚕的SSR标记

【作者】 郑茜茜； 马红方； 谌苗苗； 钟亮； 李群； 王欢； 夏润玺； 李喜升； 王凤成； 刘彦群；

【机构】 沈阳农业大学生物科学技术学院； 辽宁省蚕业科学研究所；

【摘要】 柞蚕SSR标记的开发对研究柞蚕的遗传与进化、分子遗传图谱构建、功能基因定位和克隆等有重要意义。本研究从1 500条柞蚕表达序列标签(EST)中鉴定了71个SSR位点,平均5.2 kb出现一个SSR位点。在1～6个碱基的重复基元中,以3和4个核苷酸重复为主导类型。设计合成了29对EST-SSR引物,通过PCR扩增和电泳检测鉴定了7对具有多态性的引物,测序验证结果表明其中的4对为真正的有应用价值的EST-SSR标记。建立的利用EST数据开发柞蚕SSR标记的方法,有助于进一步大量开发柞蚕SSR分子标记。更多还原