口腔扁平苔藓患者口腔微生物的宏基因组学研究

【作者】 杨菁菁； 王佳； 范媛；

【机构】 南京医科大学口腔医学院； 南京医科大学附属口腔医院；

【摘要】 目的:结合16S r DNA测序、宏基因组测序全面系统分析口腔扁平苔藓(oral lichen planus,OLP)患者口腔微生物结构变化及功能代谢变化,为OLP的病因学研究和口腔微生态防治提供研究基础。方法:首先利用扩增子测序技术对满足入组条件的20名糜烂型OLP患者,20名斑纹型OLP患者,20名健康志愿者唾液及新鲜组织标本进行16S r DNA基因测序,在此基础上,从每组中选取6例进行宏基因组测序。结果:1.16SrDNA发现三组研究对象的唾液菌群在α多样性、β多样性分析中无统计学差异,新鲜组织在群落结构多样性不同。不同样本的细菌菌属组成差异较大,经Lefse分析筛选出可作为标志物的三组间有显著性差异的物种,在唾液中,糜烂组的α-变形菌纲、β-变形菌纲、奈瑟菌目、奈瑟菌科明显升高,斑纹组的消化链球菌科、消化链球菌属等明显升高;在组织中,斑纹组的链球菌科,丛毛单胞菌科,链球菌属和弯钩菌属等明显升高;糜烂组显著升高的生物标志物物种有奈瑟菌科、莫拉氏菌科、不动杆菌属和奈瑟菌属等。2.宏基因组测序的结果一方面再次验证了三组间口腔菌群的群落结构多样性,经Kruskal-wallis分析,共有7个门,12个纲,17个目,38个科,92个属,243个种存在显著差异;另一方面,在功能方面,经Kruskal-wallis分析共有3个ko,5个KO、33个GO、25个eggNOG、4个COG、7个KOG在三组口腔微生物宏基因组间具有显著性差异。三组口腔菌群功能均以碳水化合物代谢为主。将三组KEGG代谢通路(ko)进行Wilcoxon检验,与正常组相比,糜烂组的病毒致癌作用,碳青霉烯生物合成等显著升高,斑纹组的甲状腺激素信号通路,细胞色素P450对异种生物的代谢等显著升高。结论:OLP患者口腔菌群结构及功能结构均发生显著变化,微生物菌群可能参与OLP发生发展。更多还原