利用绵羊高密度芯片对滩羊全基因组拷贝数变异的研究

【作者】 刘雪雪； 潘建飞； 马月辉； 何晓红； 赵倩君； 浦亚斌； 蒋琳；

【机构】 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所；

【摘要】 <正>引言拷贝数变异(Copy number variation,CNV)是基因组结构变异(Structural variation,SV)的重要组成部分,主要指大小从几千到数百万个碱基的DNA片段拷贝数改变,表现为亚显微水平的缺失和重复。滩羊是我国有特色的地方品种,是研究遗传变异的重要资源。然而,目前对滩羊的CNV研究还很少,基因组的CNV结构还不明确。材料方法本研究采用Illumina Ovine SNP 600K BeadChip对48只滩羊进行全基因组CNV的检测。运用PennCNV,CNVPartial和QuantiCNV三个软件进行全基因组拷贝数变异的检测。更多还原