鸭源新城疫病毒SS1株全基因序列测定及遗传进化分析

【作者】 罗宇宏； 陈强； 周迪； 主性； 段志强； 胡顺林； 刘秀梵；

【机构】 贵州大学动物科学学院； 扬州大学兽医学院；

【摘要】 <正>为了解贵州省鸭源新城疫病毒(NDV)的分子特征及遗传进化情况,对从贵州省某三穗鸭养殖场病死鸭体内分离鉴定的1株新城疫病毒(NDV) Sheldrake duck/China/Guizhou/SS1/2014 (简称SS1株)进行部分生物学特性测定及全基因测序与分析。结果表明:SS1株的MDT、ICPI和IVPI分别为52h、1.89和2.80,F基因编码蛋白的裂解位点序列为112R-R-Q-K-R-F117,HN基因编码571个氨基酸,均符合NDV强毒株特征;SS1株基因组全长为15192bp,各基因片段核苷酸序列与代表性基因Ⅶ型毒株ZJ1、NA-1、SF02和FP1/02相似性最高,达96.3%～98.7%,而与疫苗株V4、LaSota和Mukteswar同源性最低,为82.8%～85.4%;根据F基因序列绘制的系统进化树显示SS1株属于ClassⅡ基因Ⅶd亚型。更多还原