【作者】 陈默然； 王明琛； 龚音； 简柏樑； 孙啸； 肖鹏峰；

【Author】 Moran Chen;Mingchen Wang;Yin Gong;Bailiang Jian;Xiao Sun;Pengfeng Xiao;School of Biological Science and Medical Engineering, Southeast University;

【机构】 东南大学生物电子学国家重点实验室生物科学与医学工程学院；

【摘要】 高通量DNA测序技术对当代生物学、医学等领域的研究产生了巨大的影响,但其不能判断原始测序信息是否正确、将导致可能失去重要的低丰度序列信息。我们提出的两核苷酸合成测序技术为解决这一问题提供了方案[1-2],最近Chen等人实现了两核苷酸合成高通量DNA测序[3]。然而,现有两核苷酸合成测序既没有解决同聚物序列片段的测序错误,又由于测序原始数据存在一定错误率、使得判断测序信息的特征失去了意义。本文研究新型两核苷酸合成测序方法(如图1),即单个测序反应由一个核苷酸和一个可逆封闭的核苷酸(*)参与。一个循环包括依次进行的X*Y、Z*W两个测序反应、并分别得到合成核苷酸数N和M。依据N、M,可以解码为N-1个Y,1或0个X,M-1个W和一个编码(ZW);经活化、进行下一个循环、且当N’=0时,(ZW)可以确定为具体的碱基。当DNA模板通过两组测序,并将两组测序信息比较、便完成序列测定。这种技术只有正确的测序信息才能够被连续解码,可以消除现有技术的不足。更多还原

【Abstract】 In this paper, a new sequencing strategy that the sequencing reaction contains a nucleotide and a nucleotide modified with a reversible terminator(*) is studied. A cycle contains two sequencing reactions(X*Y and Z*W), and the number of incorporated nucleotides N and W can be obtained, respectively. From N and M, it can be decoded into N-1 Y, 1 or 0 X, M-1 W and a code(ZW). When a template is cyclically interrogated twice with A*G/C*T and AT*/CG*, respectively, the two sets of information allow for the bases to be sequentially decoded.更多还原