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ESI-质谱法探测人类成熟microRNA G-四链体结构的形成及识别
Probing of formation and recognition of microRNA G-quadruplex by ESI-MS
【Author】 Wei Tan;Fangyuan Li;Jiang Zhou;jinjian Li;Gu Yuan;Department of Chemical Biology, College of Chemistry and Molecular Engineering, Peking University;
【机构】 北京大学化学与分子工程学院化学生物学系北京分子科学国家研究中心生物有机与分子工程教育部重点实验室;
【摘要】 我们对人类成熟microRNA库进行检索,发现有100多条富G的microRNA具有形成G-四链体结构的可能,使用ESI-质谱法探测了富G microRNAs[例如,miR-197-5p (5’-CGGGUAGAGAGGGCAGUGGGAGG-3’,S1)]G-四链体结构的形成。ESI质谱实验表明,在H2O条件下,富G microRNAs的ESI谱图为一组不同质荷比的质谱峰;而在NH4OAc条件下,富G microRNA (S1)的ESI质谱图中的基峰为加和两个NH4+的五电荷峰([S1+2NH4+-7H+]5-),表明S1形成了稳定的G-四链体结构。此结论已使用CD谱和1H-NMR谱等方法证实。并使用ESI质谱法探讨了多个化学小分子对microRNAs G-四链体的识别和结合,发现chelerythine等天然小分子对microRNAs G-四链体结构具有高亲合性和选择性的识别功能。
【Abstract】 The bioinformatics analysis showed that there were some G-rich microRNAs in human mature microRNAs. In this work, we aim to investigate the possibility of formation of G-quadruplex from microRNAs. Here, we selected human mature mi R-197-5 p as example to probe the formation of microRNA G-quadruplex. We found that this microRNA can fold into G-quadruplex structure. Intriguingly, we found natural alkaloid, chelerythine, could bind with the microRNA G-quadruplexes with high binding affinity.
- 【会议录名称】 中国化学会第十三届全国分析化学年会论文集(二)
- 【会议名称】中国化学会第十三届全国分析化学年会
- 【会议时间】2018-06-14
- 【会议地点】中国陕西西安
- 【分类号】O657.63;R394
- 【主办单位】国家自然科学基金委员会、中国化学会