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利用含有C/C错配发卡型探针非标记荧光法检测单核苷酸多态性
Detection of Single Nucleotide Polymorphism by Label-free Fluorescence Method Using Hairpin Probes containing C/C Mismatch
【Author】 Shaolong Hou;Wentao Lu;Hongge Zhang;College of Chemistry and Chemical Engineering, Baoji University of Arts and Sciences;
【机构】 宝鸡文理学院；
【摘要】 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性。荧光方法因灵敏度高、操作简单、仪器相对便宜等优点,成为DNA测序、基因分析等领域的主要方法。本文利用茎部含有C/C错配位点的发卡型DNA探针(CCMBs)非标记荧光法检测SNPs。图1为CCMBs探针检测SNPs的原理。向CCMBs探针溶液中加入荧光小分子2-氨基-5,6,7-三甲基-1,8-萘啶(ATMND)后,ATMND与探针茎部错配C碱基结合,其荧光被猝灭。当加入与探针环部互补的目标DNA时,CCMBs探针的茎环结构被破坏,ATMND被释放出来,此时荧光有一定程度的恢复。图2为加入CCMBs探针和互补DNA前后的ATMND的荧光光谱。本文所提出的方法用于SNPs区分检测及全匹配目标DNA浓度的检测。
【关键词】 荧光法；
单核苷酸多态性(SNPs)；
C/C错配；
- 【会议录名称】 中国化学会第十三届全国分析化学年会论文集（一）
- 【会议名称】中国化学会第十三届全国分析化学年会
- 【会议时间】2018-06-14
- 【会议地点】中国陕西西安
- 【分类号】Q503;O657.3
- 【主办单位】国家自然科学基金委员会、中国化学会