基于串级质谱和同位素轮廓指纹比对的翻译后修饰组学

【作者】 田志新； 肖开捷； 薛冰冰； 王浩； 沈赟； 连浩志； 吴昊； 王悦； 韩雨吟；

【机构】 同济大学化学科学与工程学院；

【摘要】 随着软电离技术(尤其是电喷雾电离)以及高质量分辨、高质量测量精度和串级质谱功能强大的质谱仪的发展和普及,蛋白质翻译后修饰的全面解析(包括种类、位点以及结构)已经成为人类蛋白质草图绘制完成后基于质谱的蛋白质组学的研究重点。与传统基于电子轰击或化学电离的无机、有机小分子质谱不同,现代基于电喷雾的生物大分子(尤其是蛋白质)质谱出现了全新的特征,也就是质谱仪不再直接测量"质量"。本报告中,我将首先介绍我们基于蛋白质电喷雾质谱的全新特征而发展的与之匹配的原位解析算法,同位素质荷比及轮廓指纹比对(isotopic mass-to-charge ratio and envelope fingerprinting, iMEF)1;随后介绍我们基于i MEF算法发展的整体蛋白质数据库搜索引擎ProteinGoggle2、磷酸化位点准确定位工具Pbracket3、N-多糖数据库搜索引擎GlySeeker4、以及完整N-糖肽数据库搜索引擎GPSeeker;最后介绍我们基于这些生物信息学工具以及我们发展的其他质谱联用技术开展的翻译后修饰cross-talk5、磷酸化以及糖基化的鉴定的工作。更多还原