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杧果MiCOL8A和MiCOL8B基因克隆与表达模式分析

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【作者】 刘源罗聪张秀娟卢新喜余海霞何堂熹范志毅谢小杰何新华

【机构】 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室/农学院广西大学

【摘要】 CONSTANS(CO)是植物成花控制网络中的关键基因。在前期研究的基础上,从杧果转录组数据中获得了2个CO全长序列基因,命名为MiCOL8A和MiCOL8B。生物信息学分析结果显示,2个CO基因编码区序列长度分别为801bp和792bp,编码氨基酸长度为266个和263个,蛋白质分子量分别为29.75KDa和29.24KDa,等电点为8.69和4.95。功能预测表明,2个CO基因编码的氨基酸序列在C端只含有一个二级结构发生变化的锌指蛋白结构域(B-Box2),不含CCT结构域。通过构建系统进化树,显示杧果两个MiCOL8A和MiCOL8B蛋白均属于第Ⅲc类CO蛋白基因家族,与拟南芥(Arabidopsisthaliana)AtCOL11和AtCOL12相似性最高而聚类到一起。基因表达分析表明,MiCOL8A和MiCOL8B基因在杧果不同组织中及一天不同时间内均表达,但表达水平存在差异。杧果MiCOL8A和MiCOL8B基因在叶、茎、花三类组织中的表达模式相似,都是在花中表达量最高,其次是成熟茎,成熟叶中表达量最低,在花中的表达量约是成熟茎中的2倍,约是成熟叶中的4倍。MiCOL8A和MiCOL8B基因均在上午09:00时表达量最高,此时MiCOL8B基因的表达量约为MiCOL8A基因的2.3倍。以上结果说明,MiCOL8A和MiCOL8B基因与杧果成花有关,但两个基因的调控模式可能存在差异。

【关键词】 杧果MiCOL8AMiCOL8B生物信息学分析表达模式
【基金】 国家自然科学基金项目(31660561);广西创新驱动发展专项资金资助项目(桂科AA17204097-3;桂科AA17204026-2);广西重点研发计划项目(桂科AB17292010);国家重点实验室自主研究课题(SKLCUSA-a201906;SKLCUSA-c201901);国家现代农业产业技术体系广西芒果创新团队栽培岗位项目(nycytxgxcxtd-06-02)
  • 【会议录名称】 2019年全国热带作物学术年会论文集
  • 【会议名称】2019年全国热带作物学术年会
  • 【会议时间】2019-09-24
  • 【会议地点】中国陕西西安
  • 【分类号】S667.7;Q943.2
  • 【主办单位】中国热带作物学会、西北农林科技大学
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