非洲珍珠鸡的遗传多样性及环境适应

【作者】 沈全宽； Adeniyi C.Adeola； 彭旻晟； 张亚平；

【机构】 中国科学院昆明动物研究所；

【摘要】 珍珠鸡是一种原生于非洲主要是撒哈拉以南的家禽,因其生长迅速养殖成本低而被大量饲养并且为非洲一些贫穷的地区提供了主要的肉蛋来源。本研究采用群体重测序手段对采自非洲、欧洲和亚洲的野生及家养珍珠鸡进行遗传分析,期望在较大范围内获得对珍珠鸡的遗传多样性分布格局的认识以及刻画不同珍珠鸡内部的遗传结构。与前人的认识一致,我们发现来自东非和西非的野生珍珠鸡群体的核苷酸多样度明显地高于世界上其他珍珠鸡群体,意味着珍珠鸡在非洲起源驯化再进一步引入到世界其它地方。通过检查珍珠鸡群体内部的遗传结构我们提出了不同群体间可能的基因交流模式进行检验,结果表明伊朗家养珍珠鸡能和非洲野生珍珠鸡共享约27%的遗传变异,意大利家养珍珠鸡跟东非肯尼亚野生及家养珍珠鸡遗传关系较近,而西非尼日利亚的家养珍珠鸡携带着来自尼日利亚野生珍珠鸡约14%的遗传变异。另外我们也对珍珠鸡基因组上适应于非洲当地温暖干燥环境进行了正选择信号检测,拿到了一些功能富集通路。更多还原