HBs pre-S区对肝细胞长链非编码表达的影响分析

【作者】 郑颖； 何明亮； 王鑫； 樊红；

【机构】 东南大学医学院遗传与发育生物学系； 香港城市大学动物医学及生命科学院生物医学系；

【摘要】 肝细胞癌(Hepatocellularcareinorm,HCC)是全球发病率及死亡率最高的恶性肿瘤之一。引起肝癌发生的因素有多种,目前已证实慢性乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是引起HCC的主要因素。HBV的致癌机制极为复杂,目前尚不完全明确。除HBx外,以往研究发现HBs的Pre-S区与HCC的发生发展也有着密切的联系。为了探究HBs Pre-S区对肝细胞转录组表达的影响,深入全面地探究HBs前S区与HCC的相关性及其可能的作用机制,我们运用二代测序的方法对HBs Pre-S区转染的L02细胞长链非编码RNA差异表达谱进行测序分析。我们构建了Ss,Ms(含pre-S2区),Ls(含pre-S1和pre-S2区)慢病毒表达载体,分别感染肝永生化细胞LO2,建立Ss,Ms,Ls稳定表达细胞模型共4株(含对照组空载体PLVTHM),提取总RNA,构建二代测序文库并上机进行分析。测序分析结果显示:在L02细胞系中,Ss,Ms、Ls与对照组比较分别有1137,1358,2967个表达上调基因,882, 1399, 3449个表达下调基因,两两比较发现Ss和Ms,Ss和Ls,Ms和Ls分别有589,661,711个共同的表达上调基因和298, 405, 606个共同的表达下调基因,其中三组共同含有的表达上调基因有403个,表达下调基因有170个。对差异表达的LncRNA进行分析,与对照组比较,LO2 Ss细胞转录组中有101个表达上调的LncRNA,有52个表达下调的LncRNA;LO2 Ms中有83个表达上调的LncRNA,70个表达下调的LncRNA;LO2Ls中有116个表达上调的LncRNA,84个表达下调的LncRNA。根据以上二代测序的分析结果,我们将从中筛选与HCC形成相关通路中的候选基因进行验证,为后期进一步探究HBs Pre-S区在HCC的发生发展过程中起到的作用提供依据和新的思路。更多还原